R CMD檢查註釋：未發現任何呼叫：'R_registerRoutines'，'R_useDynamicSymbols'

如何避免以下注意出現在R CMD check與新的R開發版本（R開發中（不穩定）（2017-02-15 r72179））？R CMD檢查註釋：未發現任何呼叫：'R_registerRoutines'，'R_useDynamicSymbols'

• checking for unstated dependencies in examples ... OK 
• checking line endings in C/C++/Fortran sources/headers ... OK 
• checking compiled code ... NOTE 
File ‘pkgname/libs/pkgname.so’: 
    Found no calls to: ‘R_registerRoutines’, ‘R_useDynamicSymbols’ 

It is good practice to register native routines and to disable symbol 
search.

例如在Hmisc

來源

2017-02-18 Crops

該消息是有點晦澀難懂。我在其他軟件包中環顧四周，發現NAMESPACE文件中的useDynLib(packagename)被替換爲useDynLib(packagename, .registration = TRUE)。

另外，我加了一個.c文件，在src/目錄下面的代碼名爲registerDynamicSymbol：

// RegisteringDynamic Symbols 

#include <R.h> 
#include <Rinternals.h> 
#include <R_ext/Rdynload.h> 

void R_init_markovchain(DllInfo* info) { 
    R_registerRoutines(info, NULL, NULL, NULL, NULL); 
    R_useDynamicSymbols(info, TRUE); 
}

我把這個建議從GitHub Rcpp。規範性參考文獻在Writing R Extensions

另外R Devel Mailinglist提供了補充信息。

UPDATE

最直接簡單的方法是：

使用的當前R開發版本（這將最終成爲3.4）
運行tools::package_native_routine_registration_skeleton(".")複製並粘貼完整的輸出在要放入的packagename_init.c文件中src/
更新NAMESPACE，驗證useDynLib(packagename, .registration = TRUE)
如有必要，則更換exportPattern與export(list of object to be exported)

UPDATE 7月18日

正如@Symbolix使用R和最新版本RStudio的devtools點2（INIT.C注意文件）似乎由devtools（使用RStudio校驗位）或工具包處理。

來源

2017-02-20 08:28:02

我在'devtools'包中使用'@useDynLib pkg fun'來註冊C函數。 [但似乎還有更多。]（https://www.r-project.org/doc/Rnews/Rnews_2001-3.pdf#section*.51） – Crops

我有同樣的問題 - 我用你的建議這就是結果：找不到調用：'R_registerRoutines' 這意味着它找到了R_useDynamicSymbols語句。但我現在想知道，爲什麼registerRoutines錯誤並沒有消失... – stats0007

不應該是我正在做我的事實。使用funtionname而不是「functionName」而不使用package =「mypackage」的C調用表明，註冊實際上工作...？ – stats0007

我遇到了Windows構建包的一個持久性問題。（.dll而不是.so）

上面接受的答案也應該解決Windows的這個問題，但是如果它沒有解決它。確保objdump.exe指向適當的拱門。即.../Mingw_64/bin/objdump.exe。這可以通過命令提示符which objdump.exe進行檢查。不知怎的，一個32位的objdump.exe在我的路徑中找到了一個更高優先級的位置。這種拱形不匹配會產生一個File format not recognized錯誤。

來源

2017-10-14 03:07:01

R CMD檢查註釋：未發現任何呼叫：'R_registerRoutines'，'R_useDynamicSymbols'

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