我有一個現有的ggplot2散點圖,它顯示了一個參數與普通數據庫的結果。然後我想添加兩個額外的點到這個圖,我將作爲命令行參數傳遞給我的腳本script age value1 value2
。我想在每個點上面用r和l geom_text顯示這些點爲紅色。我有以下的代碼,到目前爲止,但不知道如何添加臨門一腳將數據點添加到現有的散點圖
pkgLoad <- function(x)
{
if (!require(x,character.only = TRUE))
{
install.packages(x,dep=TRUE, repos='http://star-www.st-andrews.ac.uk/cran/')
if(!require(x,character.only = TRUE)) stop("Package not found")
}
}
pkgLoad("ggplot2")
#load current normals database
df<-data.frame(read.csv("dat_normals.txt", sep='\t', header=T))
args<-commandArgs(TRUE)
#specify what each argument is
age <- args[1]
rSBR <- args[2]
lSBR <- args[3]
# RUN REGRESSION AND APPEND PREDICTION INTERVALS
lm_fit = lm(SBR ~ Age, data = df)
sbr_with_pred = data.frame(df, predict(lm_fit, interval='prediction'))
p <- ggplot(sbr_with_pred, aes(x=Age, y=SBR)) +
geom_point(shape=19, alpha=1/4) +
geom_smooth(method = 'lm', aes(fill = 'confidence'), alpha = 0.5) +
geom_ribbon(aes(y = fit, ymin = lwr, ymax = upr,
fill = 'prediction'), alpha = 0.2) +
scale_fill_manual('Interval', values = c('green', 'blue')) +
theme_bw() +
theme(legend.position = "none")
ggsave(filename=paste("/home/data/wolf/FV_DAT/dat_results.png",sep=""))
browseURL(paste("/home/data/wolf/FV_DAT/dat_results.png",sep""))
從本質上講,我想看看2個新的點落在95%的置信區間內,從正常的數據庫(藍帶)
爲什麼所有這些細節?請你能更簡潔一些。我錯過了一些東西,但是你想添加一個新的圖層和新的data.frame? – agstudy 2013-03-01 13:28:10
我想添加2個新的數據點,並將這些結果與正常的數據庫進行比較。這些點是否落在95%的置信區間內(即正常範圍) – moadeep 2013-03-01 14:14:48
我認爲你只是做'p + geom_point(data = newdata,color =「red」)'其中'newdata'是一個格式相同的數據框(即匹配列名稱)作爲原始數據集。請注意,你目前的例子是不可重現的...... http://tinyurl.com/reproducible-000 – 2013-03-01 14:27:49