與在linux某些字段去除線

Question

我有個製表符分隔的文件，其具有20列和40行

missense 
nonsense 
5' UTR 
3' UTR 

所以它們在柱9和我請求專用線與某些值保持在我的輸出，但執行此當我得到什麼輸出 因此，如果值是錯義或無義保留那些行，否則刪除它們

awk -F"\t" '$9 == "missense" || $9 == "nonsense" ' input > output 

我也曾嘗試

awk -F"\t" '$9 == "missense"' || ' $9 == "nonsense" ' input > output 

所有答案都是0字節。

Answer 1

考慮使用匹配，而不是平等的：

awk -F"\t" '$9 ~ "missense" || $9 ~ "nonsense" ' input > output 

，如果你想「這-錯義太」從輸出省略了，但在其他方面避免問題這是不是一個好的選擇與領先或尾隨空格等

Answer 2

看起來你的文件有空格和標籤。試試這個：

awk -F'[[:space:]]+' '$9 == "missense" || $9 == "nonsense"' input > output