從Java運行一個shell腳本返回「找不到命令」

我已經使用NetBeans v.8.2創建了一個java GUI。 Java非常新。從Java運行一個shell腳本返回「找不到命令」

GUI中的一個按鈕使用從GUI中的其他按鈕/文本字段收集的參數啓動shell腳本（我知道這不是理想的Java練習，但它適用於我的用例）：

``` 
     private void RunMacActionPerformed(java.awt.event.ActionEvent evt) {          
      String command[] = {scriptDirStr + "/./Master_run.sh", 
           projDirStr+"/", 
           DestDirStr+"/", 
           ECnonNormStr, 
           ECnormStr, 
           ProjID.getText(), 
           scriptDirStr +"/"}; 
      System.out.print(Arrays.toString(command)); 
      ProcessBuilder pb = new ProcessBuilder(command); 
      try { 
       Process p = pb.start(); 
      } catch (IOException ex) { 
       Logger.getLogger(NewJFrame.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex); 
      } 
     }          
    ```

所以，這個想法是用一堆參數啓動Master_run.sh。 Master_run.sh運行其它R和Python腳本，例如：

python2 $script_Path/array_data_extractor.py $spath >>$spath/masterOutput.txt 2>>$spath/masterErrors.txt

和

Rscript $script_Path/1_APS_generator_master.R $spath $dpath $APS_src_filename $project_ID $APS_norm_src_filename >>$spath/masterOutput.txt 2>>$spath/masterErrors.txt

與

cat $spath/masterErrors.txt| mail -s $Project_title" done" [email protected]

結束我知道腳本被推出因爲我收到一封電子郵件，其中包含以下錯誤：

「...... 14行：python2：命令未找到」

和

「...... 16行：RSCRIPT：命令未找到」

當我運行Master_run.sh與來自終端內部的相同的確切參數，沒有這樣的錯誤。有人知道什麼可能會出錯和/或如何解決它？

爲了解釋這個問題，我得到了不同的行爲，從java內部啓動相同的命令，直接到命令行。

來源

2016-11-16 Atticus29

您的shell環境與java環境明顯不同。嘗試指定python2和Rscript的完整路徑。例如

/usr/local/bin/python2 $script_Path/array_data_extractor.py ...

來源

2016-11-16 17:47:26

可以從腳本中獲取我的.bash_profile是否有竅門？ – Atticus29

指定完整路徑的竅門。謝謝！ – Atticus29

從Java運行一個shell腳本返回「找不到命令」

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