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我正在嘗試在r中創建一個抗肺炎克雷伯菌屬爲'Resistant','Susceptible'或'Intermediate'部分的抗生素矩陣。然而,功能我目前使用:爲什麼我的函數在創建num(0)和NULL輸出?
Klebsiella.pneumoniae.rs.mat1 <-
tapply(Klebsiella.pneumoniae.rs$resistant_phenotype, INDEX =
list(Klebsiella.pneumoniae.rs$antibiotic), FUN = function(x)
{
fracR = sum(x=='Resistant')/(nrow(x))
fracS = sum(x=='Susceptible')/(nrow(x))
fracI = sum(x=='Intermediate')/(nrow(x))
return(c(fracR, fracS, fracI))
})
的輸出:
amikacin Numeric,0
ampicillin Numeric,0
ampicillin/sulbactam Numeric,0
aztreonam Numeric,0
cefazolin Numeric,0
cefepime Numeric,0
cefotaxime Numeric,0
cefoxitin Numeric,0
ceftazidime Numeric,0
ceftriaxone Numeric,0
cefuroxime NULL
cephalothin Numeric,0
....
任何想法是怎麼回事? (原始數據是一列抗生素名稱,以及一列耐藥表型和其他一些列)
謝謝!
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