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如果我使用下面鏈接中的FASTA文件，我應該在Biopython中使用哪種字母類型？會不會是IUPAC.unambiguous_dna？我應該在Biopython中使用哪種字母表類型與FASTA文件？
鏈接FASTA文件：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/chromosomes/?C=S;O=A
A
回答
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你看過3.1 Sequences and Alphabets？它解釋了可用的不同字母，以及它們覆蓋的情況。
您提供的鏈接中有很多序列（對於我們來說太多了，無法完成）。我的建議是去UnambiguousDNA。如果四個基本核苷酸不夠，解析器將會發出抱怨，並且您應該選擇更廣泛的字母表。
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我會建議詢問biostars.org，更有可能在那裏找到更好的答案 – Stedy 2013-03-18 01:08:13