帶有多個x變量的Boxplot

我是R新手，在使用ggplot2時遇到了一些問題。帶有多個x變量的Boxplot

這是我的數據（較大的數據集的子集）的一個例子：

df <- 
structure(list(logpvalue = c(22.36, 6.93, 16.78, 1.78, 17.75, 
20.99, 21.03, 9.19, 15.01, 22.25, 13.4, 6.47, 1.34, 13.4, 3.21, 
0.37, 0.5, 0.12, 1.8, 0.71, 1.15, 6.73, 0.12, 6.97, 0.64, 9.85, 
1.45, 1.67, 2.6, 1.8, 1.35, 4.69, 0.37, 1.91, 0.31, 0, 2.45, 
1.68, 2.31, 1.35, 6.48, 4.68), SNP = structure(c(1L, 7L, 6L, 
5L, 11L, 1L, 9L, 5L, 8L, 11L, 7L, 5L, 8L, 11L, 1L, 7L, 1L, 4L, 
2L, 3L, 10L, 7L, 1L, 4L, 2L, 3L, 10L, 4L, 2L, 3L, 10L, 4L, 2L, 
3L, 10L, 4L, 2L, 3L, 7L, 9L, 5L, 1L), .Label = c("rs10244", "rs10891244", 
"rs10891245", "rs11213821", "rs12296076", "rs138567267", "rs45615536", 
"rs6589218", "rs7103178", "rs7127721", "rs7944895"), class = "factor"), 
X173 = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
2L, 2L), .Label = c("het", "hom"), class = "factor")), .Names = c("logpvalue", 
"SNP", "X173"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -42L))

我想在x軸，但與每個SNP還積的logpvalue的箱線圖在Y軸上，以SNP根據患者是het還是hom對X173進行分類。所以從這些數據中我可以想象我的箱子上有4個盒子。

如果可能的話，我還想將各個數據點（dotplot-boxplot overlay）與抖動結合起來。

這是通常的代碼我會使用logpavlue的VS SNP的箱線圖：

qplot(logpvalue, SNP, data = mydata, geom="boxplot") 
+ geom_jitter(position=position_jitter(w=0.1, h=0.1)) + theme_bw()

如何添加額外的變量x這個代碼？使用ggolot2

boxplot(df$logpvalue~paste(df$SNP,df$X173))

或者：

來源

2014-06-26 user3778714

請讓你的[數據重複性（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how例如），並閱讀[box plot]（http://en.wikipedia.org/wiki/Box_plot） – zx8754

感謝您的回覆 - 我試圖讓我的數據再現不過，它是一個大型數據集，我不想在線粘貼所有數據。不知道你對箱型圖的看法是什麼 - 我知道他們是針對多個數據點而不是個人的，因爲我之前的示例數據會給出。我幾乎無法理解任何劇本，所以我對我的無能爲力表示歉意！ – user3778714

試試這個

library(ggplot2) 

ggplot(data=df,aes(SNP,logpvalue,colour=SNP)) + 
    geom_boxplot() + 
    geom_jitter() + 
    facet_grid(.~X173)

enter image description here

來源

2014-06-26 12:17:07 zx8754

帶有多個x變量的Boxplot

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