將兩個單通道TIFF堆棧結合到單個多通道堆棧

Question

我有兩個tiff堆棧，其延時數據對應於顯微鏡實驗中獲取的不同通道。我想將它們合併成一個有兩個通道的單個堆棧。兩個堆棧都是16位灰度。

當我使用：

convert stack1.tiff stack2.tiff stack_merged.tiff 

我得到一個單一的，而是連結文件有兩個堆棧此起彼伏。

鏈接到file 1和file 2。

Answer 1

我想你需要的東西是這樣的：

#!/bin/bash 

# Get index of last frame in TIFF image 
last=$(convert stack1.tif -print "%[fx:n-1]" null:) 

# Combine all frames 
for i in `seq 0 $last`; do 
    convert stack1.tif[$i] stack2.tif[$i] -combine miff:- 
done | convert miff:- -compress lzw result.tif