設置R在Mac OS X中查找軟件包的默認URL

Question

Mac64 R> install.packages("quantmod") 

產生令人沮喪的消息。也就是說，

Warning: unable to access index for repository http://www.ibiblio.org/pub/languages  /R/CRAN/bin/macosx/leopard/contrib/2.12 
Warning message: 
In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : 
package ‘quantmod’ is not available 

沒什麼大不了的，只是通過在不同的回購，這樣的：

Mac64 R> install.packages("quantmod", repo="http://R.research.att.com") 

，一切都很好。但是，您如何設置默認回購，因此您無需每次都傳遞它？在Ubuntu中，有一個文件管理這個，但是Mac OS X的文檔有點稀疏。

Answer 1

不能告訴。如果您使用R64.app，您可以在r/Preferences/panels中設置默認存儲庫。就我個人而言，我使用的存儲庫位於託管StatLib的相同設施上，該設備顯示在某些對話框上，如美國（PA 1），但在我的「首選項」窗格上爲http://lib.stat.cmu.edu/R/CRAN。這是一個有點選項可能會感興趣：

repos: 
URLs of the repositories for use by update.packages. Defaults to 
c(CRAN="@CRAN@"), a value that causes some utilities to prompt for 
a CRAN mirror. To avoid this do set the CRAN mirror, by something 
like local({r <- getOption("repos"); r["CRAN"] <- "http://my.local.cran"; 
options(repos=r)}). 
Note that you can add more repositories (Bioconductor and Omegahat, notably) 
using setRepositories(). 

此刻我的「其他庫」中的R64.app設置爲http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/macosx/leopard/contrib/2.12/，因爲我做的事情得到一個包，只是在Ripley的網站上，但它通常設置爲R - Forge：http://r-forge.r-project.org/

Answer 2

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Managing-libraries

嘗試創建的文件夾和文件，建議UNIX類系統;在尋找回購設置時，R可能會在OS X上檢查它們。

Answer 3

查看功能幫助setRepositories;您可以在GUI中管理您的存儲庫列表或編輯文件R_HOME/etc/repositories。

你可以知道什麼是你R_HOME直接在R：如果您使用的是R64.app GUI，但猜你可能不

> R.home() 
[1] "/usr/lib/R"