如何在R中正確設置庫目錄/路徑

我的目標是定義一個單一路徑，其中R將用於安裝和搜索庫。 I read這可以通過更改R安裝路徑中的Rprofile.site文件來完成。我在那裏嘗試了兩個命令：如何在R中正確設置庫目錄/路徑

.libPaths("D:/RLibrary") 
.Library.site <- file.path("D:/RLibrary")

其中，即使在閱讀幫助文件後，我也沒有完全理解其差異。

但是在啓動R之後，圖書館仍在兩處尋找。

.libPaths() 
[1] "D:/RLibrary"      "C:/Program Files/R/R-3.3.1/library"

這是爲什麼，以及如何將庫路徑更改爲我想要的路徑？

2016-08-18 tomka

僅更改爲您所需的路徑可能不是一個好主意，因爲一些R的默認包似乎只適用於默認文件夾。但是你的「D：/ RLibrary」文件夾現在應該是它尋找軟件包的第一個地方，它應該爲你做好準備。 – mkt

也許試試packrat？這將創建一個本地項目目錄......它解決了很多令人討厭的庫混淆問題。 – Shape

我建議你不要單一的目錄中的軟件包，因爲許多基礎軟件包都帶有R.相反，你需要一個用戶將安裝軟件包的單個目錄。

創建.Renviron文件，並添加環境變量R_LIBS指向你希望你的包在最終的目錄。在我的機器，我有

# Linux 
R_LIBS=/data/Rpackages/

或者，如果您有Windows類似

# Windows 
R_LIBS=C:/R/library

你.libPaths()現在看起來有點像

R> .libPaths() 
[1] "/data/Rpackages" "/usr/lib/R/site-library"

這意味着，當我安裝一個軟件包它去/data/ncsg3/Rpackages

如果你真的想只有一個單獨的目錄，你可以設置R_LIBS_SITE變量省略的默認目錄。

2016-08-18 14:27:59 csgillespie

我很困惑。「Rprofile.site」有什麼不同？ – tomka

請參閱https://csgillespie.github.io/efficientR/set-up.html - Renviron適用於環境變量。 – csgillespie

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