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我試圖用多個圖表打印一個pdf。 我正在使用一個循環和ggplot,這也是一個函數。 我在'註釋'情節時遇到了麻煩。 我想註釋該狀況的中位數和總體中位數。 我正在使用水平線(geom_hline)和註釋('文本')來標記這些線條。在循環內註釋ggplots geom_hline是錯誤的
問題是單詞被正確放置(即註釋(「文本」,x = 1,y = Cmedian)似乎正常工作,但水平線被繪製在錯誤的位置(即。 geom_hline(aes(yintercept = Cmedian)不起作用,它總是將Cmedian行放在30處,並將allmedian行放在22.
我有時在循環或函數中有ggplot的'奇怪'行爲,想知道如何避免這種情況。
任何幫助表示讚賞。 謝謝
suspect_conds<-c(head(suspect_SumPheno[rev(order(suspect_SumPheno$zscore)),],n=20)$condition,tail(suspect_SumPheno[rev(order(suspect_SumPheno$zscore)),],n=20)$condition)
pdf(paste(out_dir,paste(set,org,"bar.SuspectConditionssumPhenoPerPlate.pdf",sep="."),sep=""))
for (i in 1:length(suspect_conds)){
cond<-suspect_conds[i]
cond_subset<-PhenoSumPerPlatPerCond[PhenoSumPerPlatPerCond$condition==cond,]
Cmedian<-median(cond_subset$sum_pheno)
allmedian<-median(PhenoSumPerPlatPerCond$sum_pheno)
plateMedians<-aggregate(sum_pheno~plate,data=PhenoSumPerPlatPerCond,median)
p<-ggplot(cond_subset, aes(x=plate, y=sum_pheno, fill=plate)) + geom_bar(stat="identity") +
labs(title=paste("total phenotypes per plate in",cond,sep=" ")) +
geom_hline(aes(yintercept=Cmedian), colour="black")+ geom_hline(aes(yintercept=allmedian), colour="black",linetype="dashed")+
annotate("text", x = 1, y = Cmedian, label = "median number of phenotypes per plate in this condition",hjust=0,vjust=0)+
annotate("text", x = 1, y = allmedian, label = "median number of phenotypes per plate",hjust=0,vjust=0)+
geom_point(data=plateMedians,aes(x=plate,y=sum_pheno),colour="black",size=4)+
theme_bw()
print(p,file=paste(out_dir,paste(set,org,cond,"bar.sumPhenoPerPlate.pdf",sep="."),sep=""))
}
dev.off()