終端編輯文件，刪除某些字符

我有一對夫婦其中有這樣的一個格式文件：終端編輯文件，刪除某些字符

 
TCTCTGGAAAGGGACGCCTGGGAGG 10 
AAAAATACATTCTAACCTCGGCGT 1 
TAATTTCATCAATATATCAATG 1 
(etc...)

我想要的空間後去除一切，讓我只得到這到底：

 
TCTCTGGAAAGGGACGCCTGGGAGG 
AAAAATACATTCTAACCTCGGCGT 
TAATTTCATCAATATATCAATG 
(etc...)

我該怎麼做？

來源

2012-06-24 Bucco

我們應該假設你有標準的Unix工具，比如sed，awk，perl等嗎？當你說你想刪除「空間之後」的所有內容時，你的意思是「之後包括」？ –

是的，包括空間後的一切。另外我有所有標準的Unix工具。 – Bucco

您可以使用awk做到這一點：

cat oldfile | awk '{print $1}' > newfile

來源

2012-06-24 19:26:04 timos

因此，所有這些方法將返回新的文件的空格和數字刪除權？ – Bucco

是的，新文件將只包含從行首的字符串 – timos

cut -d' ' -f1 file.txt

或：

sed 's/ .*//' file.txt

或

sed -e 's/[^ACTG]//g' file.txt

或

awk '{print $1}' file.txt

來源

2012-06-24 19:37:08

因此，所有這些方法將返回新的文件的空格和數字刪除權？ – Bucco

並不像timos的回答那麼簡潔和美觀:)，而是用Ruby編寫的另一個相同功能的快速示例。

#!/usr/bin/env ruby 

data = File.read("data.txt") 
f = File.open("outData.txt", "w") 
finalData = data.scan(/^\w+/) 
finalData.each {|i| f.write(i + "\n")} 
f.close

來源

2012-06-24 19:41:15

那麼所有這些方法將返回新的文件，空格和數字被刪除嗎？ – Bucco

嗨Bucco，是的下面的代碼將按照您的問題需要。如果你有一個文件包含很多行，比如「TCTCTGGAAAGGGACGCCTGGGAGG 10」，它會將它們解析爲名爲outData.txt的文件，並且只包含DNA數據 –

終端編輯文件，刪除某些字符

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