排序基於列排序命令的bash

Question

我試圖梳理基礎上，第四列該文件製表符分隔的文件。我希望文件根據第四列的值重新排序。

文件：

2 1:103496792:A 0 103496792 
3 1:103544434:A 0 103544434 
4 1:103548497:A 0 103548497 
1 1:10363487:T 0 10363487 

我想它排序是這樣的：

1 1:10363487:T 0 10363487 
2 1:103496792:A 0 103496792 
3 1:103544434:A 0 103544434 
4 1:103548497:A 0 103548497 

我試過這個命令：

sort -t$'\t' -k1,1 -k2,2 -k3,3 -k 4,4 <filename> 

，但我得到非法變量名錯誤。有人可以幫助我嗎？

Answer 1

排序的第四列只使用-k 4,4選擇。

sort -t $'\t' -k 4,4 <filename> 

您可能還希望-V更自然地排序數字。例如，產生1 2 10而不是1 10 2（詞典順序）。

sort -t $'\t' -k 4,4 -V <filename> 

如果你得到關於$'\t'錯誤，那麼確保你的shell是bash。也許你在腳本的頂部缺少#!/bin/bash？

Answer 2

我相信你有你的命令一個錯誤$。

嘗試：雖然

sort -t\t -nk4