ggplot2避免被繪製點

我正在使用ggplot2創建一個點圖。我的數據基本上是三列x_axis，y_axis和z_axis的形式，x_axis和y_axis一起表示一對，z_axis表示對數。ggplot2避免被繪製點

因此，我正在繪製x_axis與y_axis並使用z_axis爲點着色。在某些情況下，我想跳過繪製一個特定的計數，例如：1的計數發生多次，有時我想跳過繪製1，但圖例應顯示1.以下是我的代碼：

> new<-read.table("PB1_combo.txt", header=T, sep="\t") 
    > bp <-ggplot(data=new, aes(x_axis,y_axis, colour=factor(z_axis)), size=z_axis) +         
    geom_point(size=5) 
    > bp + ggtitle("PB1-PB1") 
    > last_plot()+ scale_colour_discrete(name="Counts") 
    > last_plot()+ theme_bw() 


    Sample data from PB1_combo.txt 
    x_axis y_axis z_axis 
    14  576  2 
    394  652  2 
    759  762  2 
    473  762  2 
    65  763  3 
    114  390  2 
    762  763  4 
    758  762  2 
    388  616  2 
    217  750  2 
    65  762  2 
    473  763  2 
    743  759  2 
    65  213  2 
    743  762  2

來源

2013-08-16 Mdhale

請給我們樣本數據，說明你的問題。我們沒有'PB1_combo.txt'。做到這一點的最好方法是模擬某些內容併發布代碼或發佈'dput（head（new））'。這兩種方法都在[這裏]描述（http://stackoverflow.com/q/5963269/903061）。 – Gregor

如果您不清楚如何使用數據編寫問題，請閱讀[this]（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example） – SlowLearner

首先，您應該創建一個因子z_axis。這樣，即使不是所有可能的值都存在，R也會意識到它們。

new$Count <- factor(new$z_axis)

（你真的應該選擇比new的方式以外的其他名稱。）

然後，你可以子集的數據。但是，並通過調用scale_color_discrete使用drop=FALSE顯示在圖例中缺失的水平：

ggplot(data=new[new$Count!="2", ], aes(x_axis,y_axis, colour=Count), size=z_axis) +         
    geom_point(size=5) + 
    ggtitle("PB1-PB1") + 
    scale_colour_discrete(name="Counts", drop=FALSE) + 
    theme_bw()

enter image description here

見this question，其實。

來源

2013-08-16 20:13:29 Peyton

佩頓：看起來很完美的解決方案。 – Mdhale

ggplot2避免被繪製點

回答

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