執行R腳本序列的最佳做法是什麼

Question

我有一系列需要按順序運行的R腳本。也就是說，我需要等到第一個完成之後再跟第二個一起移動。這是序列號：

one.R 
two.R 
three.R 
four.R 

我應該寫一個簡短的bash腳本來調用所有的腳本嗎？我應該如何寫它？我應該在R腳本的頂部添加什麼行？

此外，我的腳本需要共享R對象。如果我從bash調用腳本，他們仍然會使用通用的R工作區？

Answer 1

如果您的腳本需要共享對象，我只需創建一個腳本，其中功能已被切割成功能。該結構也能像服用點：

main_script.R 
support_functions_A.R 
support_functions_B.R 

然後在main_script.R您使用source的功能加載到R對話，例如source("support_functions_A.R")。這具有在一個更好的抽象層次上具有主要功能的優點。如果支持功能的數量增加，您也可以考慮爲此創建一個R包。當你的代碼也被其他人使用時，這是特別有用的。

使用bash腳本按順序調用腳本只有在不需要共享相同的R工作區時才能使用。我會避免將R這樣的功能鏈接在一起，並且專注於編寫功能而不是單獨的腳本。

如果你需要運行的R腳本的bash內的腳本，你可以添加：

#! /usr/bin/env Rscript 

在你的[R腳本的頂部，並使用chmod腳本可執行。