剖析R中

我試圖追查爲什麼一個包我已經把加載緩慢的原因（S）（相對於其他人，這是明顯慢），並運行此功能「圖書館」（使用ggplot2作爲一個例子）似乎並沒有給任何見解：剖析R中

Rprof(line.profiling=TRUE) 
library(ggplot2) 
Rprof(NULL) 
summaryRprof("Rprof.out", lines = "show")

這將產生：

$by.self 
       self.time self.pct total.time total.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 
$by.total 
       total.time total.pct self.time self.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 
$by.line 
       self.time self.pct total.time total.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 

$sample.interval 
[1] 0.02 

$sampling.time 
[1] 0.5

（和Rprof.out包含的我無法理解信息的混亂）

任何人都可以建議我如何「簡介」功能library正在做什麼？或者，我採取了錯誤的方法？

來源

2014-01-16 Andy Barbour

要清楚，我肯定不是暗示'ggplot2'加載緩慢。 –

我可能會提供一些猜測，如果你指出你的軟件包的源代碼。我會看看你在NAMESPACE中做了什麼，你的包環境中有多少個對象，等等。 – hadley

謝謝@hadley。我敢肯定，你有更好的事情要做，但代碼庫是在這裏：https://github.com/abarbour/strain –

，因爲它說在?summaryRprof的線譜部分：

如果代碼正在運行已源的參考信息保持（通過 keep.source = TRUE在source或KeepSource = TRUE在封裝 DESCRIPTION文件或某種其它那麼在剖析期間記錄關於線的起源的信息。

默認情況下，構建/安裝軟件包時不保留源代碼。如果您只運行summaryRprof()，您將看到非平凡的計時。你總是可以用KeepSource=TRUE重新安裝基礎包，但這可能比它的價值更麻煩。

另一種替代方法是使用debugonce(library)逐行呼叫library呼叫。這有點蠻力，但它可能比梳理profiling輸出更明顯。

來源

2014-01-16 22:46:55

有趣的點。爲了澄清，當你寫「基礎包」時，你的意思是我正在學習的包，還是'base'包，以便'library'的源代碼被保留？ –

@AndyBarbour：後者。 –

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