在Cython中創建一個PyCObject指針

一些SciPy函數（如scipy.ndimage.interpolation.geometric_transform）可以將指針指向C函數作爲參數，以避免在輸入數組的每個點上調用Python可調用函數。在Cython中創建一個PyCObject指針

簡而言之：

定義一個C模塊
返回一個PyCObject與&my_function指針和（任選地）一個void*指針在稱爲my_function某處函數以繞過

一些全局數據

相關API方法是PyCObject_FromVoidPtrAndDesc，您可以閱讀Extending ndimage in C以查看它的實際應用。

我對使用Cython保持我的代碼更易於管理非常感興趣，但我不確定我應該如何創建這樣的對象。任何，呃，指針？

來源

2013-05-08 F.X.

+1只是指針笑話:-p – Will 2013-05-08 14:16:55

這似乎是正確的做！：D – 2013-05-08 14:50:50

只要做到在用Cython你會用C做同樣的事情，直接調用PyCObject_FromVoidPtrAndDesc。以下是從您的鏈接移植到Cython的示例：

###### example.pyx ###### 

from libc.stdlib cimport malloc, free 
from cpython.cobject cimport PyCObject_FromVoidPtrAndDesc 

cdef int _shift_function(int *output_coordinates, double* input_coordinates, 
      int output_rank, int input_rank, double *shift_data): 
    cdef double shift = shift_data[0] 
    cdef int ii 
    for ii in range(input_rank): 
     input_coordinates[ii] = output_coordinates[ii] - shift 
    return 1 

cdef void _shift_destructor(void* cobject, void *shift_data): 
    free(shift_data) 

def shift_function(double shift): 
    """This is the function callable from python.""" 
    cdef double* shift_data = <double*>malloc(sizeof(shift)) 
    shift_data[0] = shift 
    return PyCObject_FromVoidPtrAndDesc(&_shift_function, 
             shift_data, 
             &_shift_destructor)

性能應與純C版本相同。

請注意，Cyhton要求運營商&獲取函數地址。另外，Cython缺少指針取消引用運算符*，而是使用索引等價物（*ptr - >ptr[0]）。

來源

2013-05-09 11:56:26

感謝您的正確'cimport's！過了一段時間，我正在考慮從'.h'文件導入函數並做大致相同的操作，但我不確定如何處理引用和解除引用，因此您的示例將一次性清除它;） – 2013-05-09 21:20:14

我認爲這是一個壞主意。 Cython是爲了避免編寫PyObjects而創建的！此外，在這種情況下，通過用Cython編寫的代碼可能不會提高代碼的維護...... 無論如何，你可以在你用Cython代碼

from cpython.ref cimport PyObject

導入的PyObject。

UPDATE

from cpython cimport *

更安全。

乾杯，達維德

來源

2013-05-08 18:56:22

你可能注意到我寫了**'PyCObject' **而不是'PyObject'。「PyObject」是一個普通的Python對象，而「PyCObject」是一個特殊的「PyObject」，用於保存指向原始內存地址的不透明指針。正如我所說，它被SciPy中的一些函數使用，他們只是從'PyCObject'中檢索函數指針並使用它，而沒有調用真正的Python方法的開銷。 ;） – 2013-05-08 19:03:00

在Cython中創建一個PyCObject指針

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