通過命令行從PHP傳遞數組到R

Question

我有一個問題，即通過命令行從php執行R腳本，我需要給它兩個數組進行計算。

我通過運行調用腳本：

Rscript nls.R ??? ??? 

???和？是我需要「給」R的數組，以便它計算某些值。

任何人都知道如何做到這一點？它不僅限於php，因爲它是命令行 - 我只需要知道一個數組是否可以通過命令行傳遞給R以及如何。

R怎麼會抓住它，用什麼命令？

非常感謝。

問候

Answer 1

你正在尋找的命令是commandArgs()。現在

，如果你有例如列表中，如果用逗號在字符串分隔的整數，就可以得到整數

s = '1,2,3,4,5' 
your_list = lapply(strsplit(s, ','), as.numeric)[[1]] 

可能有更直接的方式實現這一目標。

編輯：

更好的例子（也應與RSCRIPT工作）

$ R "1,2,3,4,5" 
... 

>lapply(strsplit(commandArgs()[[2]], ','), as.numeric)[[1]] 
[1] 1 2 3 4 5 

Answer 2

你不能這樣的事情（當然，不容易）傳遞給Rscript。 Rscript有-e選項，其中可以有多個，即R表達式。因此，您可以讓PHP生成一個字符串，該字符串是創建數組的R表達式，並傳遞每個表達式以通過單獨的-e參數創建一個數組。

您還可以傳遞R功能commandArgs()可以抓取並提供給您的命令行參數。看到一個例子here，但是你可能需要弄清楚參數是如何通過並由R進行評估的。

根據數組的大小，上面這些可能不會有用。在這種情況下，您將不得不查看與R通信的其他方式，而不是通過Rscript。

Answer 3

您必須修改您的R腳本幷包含致電commandArgs()的電話。當與選項trailingOnly=TRUE一起使用時，它將在調用後返回一個帶空格分隔參數的字符向量。這將允許您進一步操縱參數。

給定一個腳本myscript.r：

#My script 
x <- commandArgs(trailingOnly=TRUE) 
print(x) 
print(str(x)) 

你可以在命令行Rscript myscript.r 1 2 3打電話，並得到

Loading required package: ... 
... 
[1] "1" "2" "3" 
chr[1:3] "1" "2" "3" 
NULL 

F:\Temp 

這給你傳遞的文本文件名與您的陣列的可能性Rscript。如果我結合不同的語言，我通常使用文本文件來保存中間結果，這使事情變得更加順利。

小心，如果你使用任何的RSCRIPT的選項（例如--no保存），你有腳本之前把它們，例如Rscript --no-save myscript.r

Answer 4

假設你想在服務的過程運行R.一個網頁，有一些比命令行更好的調用R的方法;問題是R解釋器啓動非常慢，並且你浪費了大量時間和CPU功率來重複啓動它。

例如，您可以製作一個小型R服務器triggr，並使用用PHP套接字製作的客戶端與它交談。
更簡單但更重的想法是製作一個rApache應用程序，並使用CURL與它交談或直接將其作爲AJAX或甚至HTML提供程序使用。