我們是很陌生的Python將參數傳遞給一個Python腳本,我試圖從運行bsPlugins以下Python腳本: https://github.com/bbcf/bsPlugins/blob/master/bsPlugins/FileConvert.py
我下載的Python 2.7,所需模塊(biopython,bioscripts,bbcflib,bsPlugins ),現在可以運行在bash中:從慶典
python FileConvert.py
沒有任何錯誤消息。我現在正在努力向腳本傳遞參數。我在源代碼中看到了opt變量,但我對如何提供它們無能爲力,或者至少得到了有關預期語法的信息。
'FileConvert.py'似乎沒有采取任何命令行參數,所以我不知道爲什麼你希望它是能夠做到這一點。你可能不得不自己重寫它,所以它實際上可以使用像'argparse'這樣的模塊來解析命令行參數。 –
該腳本假設將給定的文件轉換爲指定的格式。請參閱此處:http://bbcf.epfl.ch/bsplugins/_modules/bsPlugins/FileConvert.html#FileConvertPlugin – Zoz
您可以嘗試詢問該插件的提供者該如何工作。該文件似乎最差。 –