刪除文本分號

Question

後，我有一個列的文件如下圖所示

chr1 899766 899766 G T exonic;exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV;nonsynonymous SNV 

我想以後刪除文本「;」在列6和9.輸出應該看起來像：

chr1 899766 899766 G T exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV 

有人可以給一個Linux命令來解決這個問題。

Answer 1

這將刪除包含;以及在任何字段後的部分，假定字段由製表符分隔。

sed 's/;[^\t]*//g' <file> 

如果你想這樣做只是在第6和第9個字段：所需的輸入

perl -lne '@F=split/\t/;$F[$_]=~s/;.*// for(5,8);print join"\t",@F' <file> 

Answer 2

，我已經使用sed

echo "chr1 899766 899766 G T exonic;exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV;nonsynonymous SNV" | sed 's/;[a-zA-Z]* [a-zA-Z]*//g' 

輸出

chr1 899766 899766 G T exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV 

它只會k代表「word;word」或「word word;word word」