自從最新的Ubuntu發行版（karmic考拉）發佈R

後，我注意到內部R軟件包在啓動時發佈了REvolution軟件包。它似乎是用於高性能矩陣計算的庫集合。顯然，它似乎確實有效。例如在矩陣轉置與革命：自從最新的Ubuntu發行版（karmic考拉）發佈R

> system.time(t(matrix(rnorm(10000000),ncol=1000))) 
    user system elapsed 
    1.280 0.150 1.556

而且沒有革命：

> system.time(t(matrix(rnorm(10000000),ncol=1000))) 
    user system elapsed 
    1.320 0.170 1.725

是使用的人呢？它真的有用嗎？它正在改進哪些特定類型的計算以及如何？有什麼缺點？

感謝:-)

來源

2009-11-17 Federico Giorgi

你似乎有兩次「沒有」的情況。 – 2009-11-17 14:58:42

是的，在多核計算機上，實現BLAS的 - 由包revolution-mkl提供並由包r-revolution-revobase打開的英特爾MKL庫將爲線性代數問題並行工作，您應該看到與只使用libblas *包的基本案例。

但是，你上面的例子不是顯著，我經常做這樣的事情

mean(replicate(N, system.time(someStuffHere())["elapsed"]), trim=0.05)

來計算截尾平均超過了許多重複的。

更重要的是，請注意，您的示例中包含的RNG的繪製時間爲 i）昂貴，ii）對所用方法不變，因此您應該在system.time()之外生成該方法。

除了MKL之外，revolution-r還引入了一些來自CRAN的可用於並行執行的REvolution創作的軟件包。

（聲明：我把這個共同的Ubuntu 9幫助REVO。10）

來源

2009-11-17 13:37:41

謝謝，還有關於計時的提示:-) – 2009-11-17 16:55:29

我在Ubuntu 13.04上安裝了革命性的r，並且基於基準2.5腳本，安裝後性能完全沒有變化。我想知道是否有問題。請看這個問題：http://askubuntu.com/questions/297968/how-to-make-revobase-package-work-in-r-3-0-1 – qed 2013-08-24 11:14:04

現在我已經在R3上使用了基準腳本.0.1和R2.15，帶或不帶旋轉r，結果幾乎相同。有人可以證實這一點嗎？ – qed 2013-08-24 11:31:30

有關更多信息，請參見本blog post從革命。 REvolution R 3.0應該從CRAN與R-2.9.2 100％兼容。基本上，他們使用多線程，高性能線性代數庫和優化編譯器。革命增強功能包括：優化以利用處理器高速緩存，矢量指令和多線程（Intel Math Kernel Library - MKL）和

優化編譯器和運行時庫的優點

高性能數學庫。

REvolution網頁上有一些基準：REvolution R Performance和Simple Benchmarks。

雖然他們已經下OSS許可證（foreach，iterators，doSNOW和doMC）貢獻了幾個有趣的擴展到R社會，MKL擴展是專有的。

就我個人而言，我已切換到（CRAN）R 2.10.0以擁有最新的R功能。

來源

2009-11-17 13:33:59 rcs

只是爲了重申Dirk提到的關於時機的問題 - 在你的情況下，幾乎所有的時間都在構建矩陣。看看會發生什麼（我的系統，在這裏我沒有革命的），當我抽出它的計時功能外：

> system.time(t(matrix(rnorm(10000000),ncol=1000))) 
    user system elapsed 
    2.256 0.317 2.576 

> mt <- matrix(rnorm(10000000),ncol=1000) 
> system.time(t(mt)) 
    user system elapsed 
    0.137 0.070 0.204

換句話說，超過90％的時間都花在構建矩陣中，在10 ％轉換它。

來源

2009-11-18 20:42:11

自從最新的Ubuntu發行版（karmic考拉）發佈R

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