0
當我使用nextflow提交作業時,其中一個進程失敗,並且文件損壞。很明顯,我可以從作業列表中刪除該文件,但我不希望這種情況在將來擴展時發生。默認情況下,這會停止所有其他進程(9)運行,並且下一個流作業完成。1進程中的Nextflow錯誤會停止所有其他進程
如何阻止這一失敗的工作影響其他人?
當我使用nextflow提交作業時,其中一個進程失敗,並且文件損壞。很明顯,我可以從作業列表中刪除該文件,但我不希望這種情況在將來擴展時發生。默認情況下,這會停止所有其他進程(9)運行,並且下一個流作業完成。1進程中的Nextflow錯誤會停止所有其他進程
如何阻止這一失敗的工作影響其他人?
我在這裏找到了一些在文檔中挖掘的答案(https://www.nextflow.io/docs/latest/process.html#errorstrategy)。我需要在我的過程中添加errorStrategy'finish'
process ignoreAnyError {
errorStrategy 'finish'
script:
<your command string here>
}