插入多張圖片中的for循環到Sweave文檔

我有五個圖像存儲如下（其中「currentDirectory所」是結果我從命令getwd得到（））：我想寫插入多張圖片中的for循環到Sweave文檔

currentDirectory/results/thePlot_1.jpg 
currentDirectory/results/thePlot_2.jpg 
currentDirectory/results/thePlot_3.jpg 
currentDirectory/results/thePlot_4.jpg 
currentDirectory/results/thePlot_5.jpg

Rstudio中的.Rnw腳本將創建.tex文件，然後我可以運行pdflatex以生成包含這五個圖像的.pdf文件。下面是我曾嘗試：

\documentclass{article} 
\usepackage{float, hyperref} 
\usepackage[margin=1in]{geometry} 
\usepackage{graphicx} 
\usepackage{hyperref} 
\usepackage{caption} 
\usepackage{algorithm} 
\usepackage{algorithmic} 

\begin{document} 
\SweaveOpts{concordance=TRUE} 

\author{myName} 
\title{myTitle} 

\maketitle 

<<options, echo=FALSE>>= 
library(knitr) 
    opts_chunk$set(cache=TRUE) 
@ 

\section*{mySection} 

\FOR{i in 1:5} 
nPlots=i 
plotName = "thePlot" 
outDir = "results" 
\includegraphics{paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, sep="")} 
\ENDFOR 

\end{document}

對於我收到幾個錯誤：

第25行：未定義的控制序列。第29行：缺少$插入。第29行：LaTeX錯誤：未找到文件`paste（getwd（），「/」，outDir，「/」，plotName，「_」，i，sep =「」）。第29行：缺少$插入。第30行：未定義的控制序列。

任何幫助非常感謝！

編輯1：我考慮到了亞歷克斯A.的建議，並改變了部分以包含\ Sexpr {}表達式如下：

\FOR{i in 1:5} 
\Sexpr{nPlots=i} 
\Sexpr{plotName = "thePlot"} 
\Sexpr{outDir = "results"} 
\includegraphics{\Sexpr{paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, sep="")}} 
\ENDFOR 

\end{document}

不過，現在我收到一個錯誤：

object 'i' not found

我試着在改變條件的for循環也包括\ Sexpr {}比如：

\FOR{\Sexpr{i in 1:5}}

但THI我得到了錯誤：

Unexpected 'in'

任何幫助表示讚賞！

編輯2：

我試着考慮建議乾脆把for循環和圖像插入RCODE。所以，我試圖用JPEG庫及其readJPEG方法，如下圖所示：

<<echo=FALSE>>== 
library(jpeg) 
@ 

<<plots, echo = FALSE, fig = TRUE, figs.only = TRUE, results = hide>>= 
for (i in 1:5){ 
    nPlots=i 
    plotName = "thePlot" 
    outDir = "results" 

    img <- readJPEG(paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, ".jpg", sep="")) 
    plot(img) 
} 
@ 

\end{document}

不幸的是，這還導致了錯誤：

unexpected 'in'

此外，當我單獨運行下面的代碼（未在for循環或.Rnw文件）：

nPlots=1 
    plotName = "thePlot" 
    outDir = "results" 

    img <- readJPEG(paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, ".jpg", sep="")) 
    plot(img)

生成的圖像看起來比我所（位於currentDirectory所/結果/ thePlot_1.jpg）的.JPEG圖像

0不同

來源

2015-06-08 LanneR

嘗試在'\ Sexpr {}'中包裝'粘貼（...）'。 –

@AlexA .:感謝您的幫助。它似乎確實解決了這個問題，儘管看起來for循環仍然不能像我所希望的那樣工作。你對這個新出現的錯誤有什麼建議嗎？ – LanneR

我不認爲使用'\ For'和'\ EndFor'來包含多個圖是最好的方法。（我其實不認爲你可以這樣做）。我可能會做一個R塊，比如'<< plot，echo = FALSE，fig = TRUE，figs.only = TRUE，results = hide >>'（ R代碼來顯示圖）'@'。這會自動嵌入它們。 –

從the Sweave Manual：

A.7 Creating several figures from one figure chunk does not work

要麼手動保存的曲線，並使用乳膠包括（所推薦的Sweave手冊）或切換到knitr插入。我會推薦後者。

來源

2015-06-11 20:59:39 Thomas

感謝您的建議。這看起來很明顯，但我不瞭解切換到Knitr。當我將編寫的代碼與Knitr的一個簡單示例進行比較時，它們看起來幾乎相同（https://github.com/yihui/knitr/blob/master/inst/examples/knitr-minimal.Rnw）。我真的很難看到如何儘可能無痛地開始解決這個問題。 – LanneR

@LanneR在很多情況下，爲Sweave寫的.Rnw對於knitr來說工作得很好，但有時候你需要做一些改變。本文檔概述瞭如何轉換：http://yihui.name/knitr/demo/sweave/。唯一的區別是Sweave並不是真正處於積極的發展階段，並且存在侷限性（就像你遇到的那樣），而且knitr正處於積極的發展階段（並且沒有你遇到的限制）。 – Thomas

謝謝。正如Yihui博客上發佈的那樣，我使用了Sweave2knitr命令。唯一的變化是\ SweaveOpts {concordance = TRUE}之後的部分（請參閱第三次編輯）。 \ FOR語句仍然出現「未定義的控制序列」錯誤。再次感謝您的建議。 – LanneR

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