解析R腳本中的命令行參數

Question

是否有任何方便的方法來自動解析傳遞給R腳本的命令行參數？

有點像perl的Getopt::Long？

Answer 1

上有CRAN三個包：

• getopt：C類getopt的行爲
• optparse：命令行分析器的靈感來自Python的optparse庫
• argparse：命令行可選的，位置參數解析器（由Python的argparse庫啓發）。該軟件包要求安裝Python解釋器，其中包含​​和json（或simplejson）模塊。

更新：

• docopt：允許您通過只是付出的特定格式的描述定義了一個命令行界面。它是一個港口。
• argparser：純粹在R中編寫的跨平臺命令行參數解析器，沒有外部依賴關係。這個包在Rscript前端很有用，並且有助於將R腳本轉換爲可執行腳本。
• minimist：與最小化JavaScript庫的綁定。該模塊實現了樂觀主義者參數解析器的膽量，沒有任何幻想裝飾（沒有外部依賴）
• optigrab：使用簡單，乾淨的語法從命令行解析選項。它只需要很少或沒有規範，並支持短期和長期選項，GNU，Java或Microsoft風格的語法，動詞命令等等。

Answer 2

最簡單的方法是使用commandArgs（）。示例 - 將以下代碼保存爲「options.R」：

options <- commandArgs(trailingOnly = TRUE) 
options 

使用「Rscript options.R x y z」運行。結果：

[1] "x" "y" "z" 

即 3個元素，每一個自變量的列表。

Answer 3

只是爲了補充RSCRIPT答案：

edd@max:~$ r -e 'print(argv)' flim flam flom 
[1] "flim" "flam" "flom" 
edd@max:~$ 

我們只是在littler使用argv。我和getopt這兩個可用的解析包中較老的一起祝你好運。

Answer 4

我可以在Xmisc包中引入ArgumentParser包嗎？這是一個由Python的​​啓發的命令行解析器，但它不含Python。

http://cran.r-project.org/web/packages/Xmisc/vignettes/Xmisc-ArgumentParser.pdf