用R向量查詢sqlite數據庫的有效方法

我在R中有一個向量值，並想從sqlite數據庫獲得響應值。我使用下面的代碼。用R向量查詢sqlite數據庫的有效方法

values = c() 

for (a in keys) 
{ 
    result <- dbGetQuery(con," SELECT content FROM aacontent WHERE Id=?",a) 
    values = c(values,results) 
}

不幸的是，這個代碼是非常緩慢的。有沒有更好的方法來做到這一點？

感謝，

約翰內斯

我可能會將您的SQL查詢從'Id ='更改爲'Id IN（...）'。「鍵」字符，數字，......中的值？ – joran 2012-01-28 00:20:05

他們是字符。您是否建議在IN之後將整個矢量放入括號中？那會保留正確的順序嗎？ – 2012-01-28 01:07:00

可能不是（它將取決於按鍵的順序）。我會在查詢中選擇'content'和'Id'，然後對結果進行排序，無論是在SQLite中，還是在R中的事實之後進行排序。 – joran 2012-01-28 01:10:05

如果aacontent不是非常大，那麼讀取所有到R和使用的東西，如R的匹配功能，或sqldf功能，或data.table功能

如果aacontent對於那個來說太大了，而且鍵是small-ish，那麼把鍵寫入一個sqlite表並且執行連接查詢。您可以從其中一個或兩個創建索引中受益。

2012-01-28 00:34:02 Spacedman

謝謝，編寫關鍵字並執行連接查詢極其有用。 – 2012-02-19 04:01:37

的肯定是預先構建工具，SQL與R查詢類似這樣的任務（因爲你使用SQLite，我一定要看看sqldf），但在我的經驗，我剛寫出來很多用於構建查詢的小幫助包裝函數。

例如，在你的情況下，你的問題不是真正的R部分，而是你想將keys中的所有值放入一個查詢中。所以，你想要一個查詢，看起來更像是：

SELECT content FROM aacontent WHERE Id IN (val1,val2,...)

，然後訣竅是R中使用paste打造IN條款。我傾向於在dbGetQuery上使用一個簡單的包裝函數，它使用...參數和paste將各種查詢拼湊在一起。事情是這樣的：

myQuery <- function(con,...){ 
    arg <- list(...) 
    res <- dbGetQuery(con,paste(arg,collapse = "")) 
    res 
}

所以，這是一個有點容易縫合在一起的東西用IN條款時：

myQuery(con,"SELECT content FROM aacontent WHERE Id IN (", 
      paste(keys,collapse = ","),"))

請注意，這是一個有點困難，如果在keys值是人物，從此你需要與paste做更多的工作來獲得每個元素的單引號，但這不是那麼多的工作。

如果所討論的數據庫相當小，這個建議更加相關;如果你處理更大的數據，Spacedman的建議可能更值得關注。

2012-01-28 00:45:04 joran

http://xkcd.com/327/適用於此。 – Spacedman 2012-01-28 09:10:59

@Spacedman取決於設置的細節。在我的情況下，我的數據庫只能被身邊的人查詢，所以我傾向於不擔心這樣的事情，因爲如果某個人真的有我的電腦，我就會遇到比SQL注入攻擊更大的問題。 – joran 2012-01-28 10:12:44

是的，但它不只是你不必擔心的惡意攻擊。一旦你開始構建字符串傳遞給SQL表達式，你不得不擔心引號和分號等等。 R的DB包中是否有sql轉義函數或佔位符替換技術？ – Spacedman 2012-01-28 11:59:44

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