2012-10-20 19 views
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任何人在R和SLEPC的綁定中都有很多運氣?尋找在R.更快SVD和特徵值算法R對SLEPC/PETSC的結合?

更新:我在這兩種情況下一般興趣(速度VS級)

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[Cross在R-SIG-HPC上發佈](https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-hpc/2012-October/001542.html)。 –

回答

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我不明白:

  1. SLEPC是可擴展即非常大的問題

  2. 你問更快的SVD

如果你是速度之後,我會考慮

  • 快速實現,要麼像RcppEigen

  • 加速BLAS如OpenBLAS它可以對R一個下拉,如果R建立了正確的方式。

但如果你是後大問題,也許是新pbd-r.org項目,包裝的ScaLAPACK可以幫助真的。

所以請讓我們知道,如果你是後速度規模

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對這兩種情況都感興趣。 – pslice

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讓我猜猜:小馬呢?非常嚴肅地說,有_tradeoffs_,所以你最先想要哪個? –

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最有可能的是,速度(代碼的可移植性)。 – pslice