2014-11-07 97 views
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在Linux Mint 17上運行R 3.1.2,當我嘗試安裝流行的軟件包時,出現non-zero exit status。一個例子install.packages嘗試的完整輸出如下:在Linux Mint上無法安裝R軟件包17

> install.packages("plyr") 
Installing package into ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/plyr_1.8.1.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 393233 bytes (384 Kb) 
opened URL 
================================================== 
downloaded 384 Kb 

* installing *source* package ‘plyr’ ... 
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
** libs 
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include" -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o 
/bin/bash: g++: command not found 
make: *** [RcppExports.o] Error 127 
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’ 
* removing ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/plyr’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/RtmpXe52Mz/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("plyr") : 
    installation of package ‘plyr’ had non-zero exit status 

我得到本質上的其他包我嘗試安裝,如ggplot2vegan,儘管在許多情況下,它是更冗長,因爲它試圖和相同的消息未能安裝依賴關係。

這似乎是一個有點常見的問題,但其他人似乎有outdatedsoftwareinsufficientmemory。我正在運行Mint和R的最新穩定版本,並且我有大量的RAM和交換文件,所以我不認爲這些都會導致我的問題。

回答

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每錯誤消息

/bin/bash: g++: command not found 

你需要安裝一個C++編譯器。我將與其中的一個開始:

sudo apt-get install build-essentials  # key tools 

sudo apt-get install r-base-dev    # many development tools for R 

或課程

sudo apt-get install r-cran-rcpp    # to not install from source 

的雖然RCPP你可能比你需要的一個更老。

對於基於Debian的系統的用戶,有一個列表r-sig-debian

+2

非常感謝將來的讀者,'sudo apt-get install r-base-dev'爲我打開了訣竅。 – Joe 2014-11-11 03:14:06

+1

偉大的答案@DirkEddelbuettel! – Quantopik 2015-03-16 22:58:33

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在我的情況下,我正在運行一個相當新的Mint 18安裝,並且我錯過了某些軟件包。根據R中的錯誤消息,我試圖安裝「readr」,但是因爲我缺少一個底層軟件包「libcurl4-openssl-dev」,所以無法安裝。我apt-got了,然後readr安裝沒有錯誤,現在我的RStudio包按預期加載。