knitr奇怪的失控行爲與數字

我得到奇怪的數字行爲。在一些塊中，knitr從單個繪圖函數生成兩個圖形，並且從'塊名'生成的圖形被命名爲「塊名1.1. pdf」和「塊名2.2.ddf」。有時候，第一個只是一個與第二個大小相同的空白圖形，有時卻是一個無法打開的文件。作爲解決辦法，我設置了fig.keep='last'選項。但是現在我想顯示來自同一個塊的兩個圖並將fig.keep設置爲其默認值，knitr生成3個PDF圖形文件，第一個文件是損壞的文件（無法打開）。knitr奇怪的失控行爲與數字

我已經Win7的64下knitr版本1.2（2013年4月10日）中，R 3.0.0版64位（2013年4月30日r62697）下面是我使用的設置：

knit_hooks$set(par = function(before, options, envir) { 
    if (before) par(mar = c(4, 4, .1, .1)) 
}) 

opts_knit$set(concordance=TRUE, self.contained=TRUE) 

opts_chunk$set(fig.path="figSW/SW-", keep.source=FALSE, 
    verbose=TRUE, message=FALSE)

我無法用一個簡單的例子來重現它。然而，試圖創建這樣一個例子，我發現了其他奇怪的結果。在下面的示例中，只有曲線圖1,2和10被正確顯示，而其他所有曲線都沒有顯示（不生成PDF文件，並且不會在.tex文件中生成一致的\includegraphics）。

\documentclass[12pt,a4paper]{article} 
\begin{document} 
Plot 1 
<<test-t, echo=TRUE, results="asis", fig.width=10, fig.height=5>>= 
x = c(1,2,3) 
y = c(1,3,2) 
plot(x,y) 
@ 
Plot 2\\ 
<<test-tt, echo=FALSE, results="hide", fig.width=10, fig.height=5>>= 
plot(x,y) 
@ 
\newpage 
Plot 3 
<<test-s, echo=TRUE, results="asis", fig.width=10, fig.height=5>>= 
x = c(1,2,3) 
y = c(1,3,2) 
plot(x,y) 
@ 
Plot 4\\ 
<<test-ss, echo=FALSE, results="hide", fig.width=10, fig.height=5>>= 
plot(x,y) 
@ 
\newpage 
Plot 5 
<<test-r, echo=TRUE, results="asis", fig.width=10, fig.height=5>>= 
x = c(1,2,3) 
y = c(1,3,2) 
plot(x,y) 
@ 
Plot 6\\ 
<<test-rr, echo=FALSE, results="hide", fig.width=10, fig.height=5>>= 
plot(x,y) 
@ 
\newpage 
Plot 7 
<<test-v, echo=TRUE, results="asis", fig.width=10, fig.height=5>>= 
x = c(1,2,3) 
y = c(1,3,2) 
plot(x,y) 
@ 
Plot 8\\ 
<<test-vv, echo=FALSE, results="hide", fig.width=10, fig.height=5>>= 
plot(x,y) 
@ 
\newpage 
Plot 9 
<<test-u, echo=TRUE, results="asis", fig.width=10, fig.height=5>>= 
x = c(1,2,3) 
y = c(1,3,2) 
plot(x,y) 
@ 
Plot 10\\ 
<<test-uu, echo=FALSE, results="hide", fig.width=10, fig.height=5>>= 
plot(x,y) 
@ 
\end{document}

即使是陌生人，從R-Studio中編譯相同的文件，我得到了除積6至1,2和10

來源

2013-05-20 Gilbert

預期的結果使用您的例子，knitr我不能重現該問題1.2/R 3.0 。我預計所有10個地塊。

對於損壞的PDF數字，它似乎是在開發版本knitr中已修復的錯誤。你可以試試

install.packages('knitr', repos = 'http://www.rforge.net/', type = 'source')

來源

2013-05-23 03:33:59

謝謝你，安裝開發版本解決了我的問題與空白和損壞的圖形文件。它還改善了重複塊的例子的結果。現在我可以看到所有的地塊，但3和4. – Gilbert

編譯從R-Studio與開發版本的knitr我可以看到所有的情節，但情節10. R-Studio說：「問題：1 badbox'，但我不知道什麼這意味着。 – Gilbert

這個問題並不重要。 –

knitr奇怪的失控行爲與數字

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