通過PHP使用R

我對R相對比較陌生，對Linux（Ubuntu）命令行也很新穎。我正在嘗試在PHP中編寫一個頁面，其中包含一個我想在R中執行的命令，然後將結果傳回以便能夠與它們一起工作。我試過下面的代碼的變化，但我只得到將R歡迎消息作爲我的輸出：通過PHP使用R

<?php 

$rQuery = "\"echo 3 + 1;\" | /usr/bin/R --no-save"; 
exec($rQuery, $output); 
print_r($output); 

?>

當我手動輸入$ rQuery在命令行的結果是我所期待的：[1] 4.
我知道我必須在那裏結束一些事情，但是我一直沒能通過自己的搜索找到答案。

來源

2011-01-27 crix

幾點：

你想--slave作爲選項，這意味着--no-save並開啓關閉問候;更多信息請參閱手冊。
你真的想要的是傑夫·霍納的優秀R-內的Apache，看到here for more。它也可以使用模板框架，如brew。最重要的是，Jeff現在爲您提供了一個.deb軟件包：在/etc/apt/sources.list中使用deb http://ppa.launchpad.net/jeffreyhorner/rapache/ubuntu lucid main。
如果你堅持要用php管道，請考慮littler腳本前端Jeff和我寫的。它會啓動速度比R.

來源

2011-01-27 16:27:37

1.謝謝！你不知道這多麼令我討厭。 2.這看起來非常有用，一旦我在這些東西中變得更好，我會研究它。這正是我所尋找的。感謝您的寫作！如果其他人好奇，我可以通過使用以下命令獲得準確的結果：「<？php $ rQuery =」r -e'cat（3 + 1）'「; system（$ rQuery）;？ >「 – crix 2011-01-27 17:24:37

快樂。 Littler（例如`/ usr/bin/r`）出於同樣的原因使用該選項啓動它的嵌入式R實例。 – 2011-01-27 17:27:14

無論用戶apache運行的是什麼，可能都沒有相同的環境變量或權限，因爲它們是手動從shell運行的。找出Apache運行的用戶名，並確保它具有正確的權限和環境變量。

來源

2011-01-27 16:12:29 profitphp

謝謝，在R中嘗試更復雜的命令時，我開始遇到這個問題。 – crix 2011-01-27 20:31:47

對於一些這個簡單，你甚至不應該使用PHP，因爲你可以用RApache，brew包和普通的HTML僅僅做到這一點（CSS/JS是可選的）。請閱讀the RApache manual並參閱Jeroen Ooms的video tutorial。您還應該閱讀brew手冊。傑夫確實做得很好！

簡而言之，你只需要設置apache2.conf或的.htaccess文件。您可以使用<FilesMatch>指令，而不是使用<Directory>或<Location>指令，以便將文件與regexpr匹配。下面是一個示例的.htaccess：

<FilesMatch "^.+\.rhtml$"> 
    SetHandler r-script 
    RHandler brew::brew 
</FilesMatch>

我使用特殊的文件擴展名.rhtml，我內<%和%>標籤（見brew文檔）混合有R語法HTML。我沒有使用brew與PHP，因爲brew與HTML做的伎倆。

不管怎樣，你說，你想：

用PHP編寫的網頁包含命令我想中的R 執行，然後將結果傳遞迴是能夠一起工作他們

關於執行來自用戶輸入的命令......好吧......不要這樣做！特別是不允許用戶執行自定義命令，因爲他們可以輕鬆地通過system或file.*命令並使您的系統癱瘓！您可以使用AppArmor的，但它仍然是一個很長的路下來...
專注於簡單的HTML表單和使用POST，GET，COOKIES，FILES和服務器變量RApache提供，並然後操縱R腳本
關於「傳遞結果」的輸入，您可以使用XML R包或rjson（我最喜歡的，我推薦它）。然後，您可以將R對象傳遞給toJSON函數，並使用JavaScript反序列化它。當然，只有當你的客戶端是網頁瀏覽器時纔是這樣，否則，如果你想將某些信息傳遞給嵌入式系統，你應該使用標準的XML-
這樣簡單的事情，你不需要需要PHP。無論如何，你應該聯繫的Jeroen，我知道他用了一些PHP在他Stockplot應用

如有其他問題，請RApache mailing list。

...和你好R-webdev世界！ =）

來源

2011-01-27 18:53:52 aL3xa

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