所以到目前爲止我得到的是一個Bed-Table文件，這個文件的問題是，在某些行中，值在第2列中的值大於第3列中的值。AWK：需要交換兩列之間的值，如果左邊的一個比右邊的小
awk中是否有任何一個班輪，它們將交換這兩個值，以便表格總是在列2中獲得較小的值，在列3中獲得較大的值？
chr01 100 200
chr02 300 150
所以在這個例子中，所需的輸出將是：
chr01 100 200
chr02 150 300
只是交換列，如果他們是在錯誤的訂單，使用臨時變量：
$ awk '$2 > $3 { temp = $3; $3 = $2; $2 = temp } 1' OFS='\t' file
1最後是{print}的通用速記，所以每行都打印出來。將輸出字段分隔符OFS設置爲製表符保留了格式。
或者：
$ awk -F'\t' '$2 > $3 { $0 = $1 FS $3 FS $2 } 1' file
如果必要重新排列行的內容，使用輸入字段分隔符FS它已被設置爲製表符。
你可以用awk，
awk '$2>$3{x=$3;$3=$2;$2=x}1' file
該命令會切換所需的值，但它會導致錯誤，因爲它會以某種方式刪除列之間的選項卡 – JadenBlaine
'awk'$ 2> $ 3 {x = $ 3; $ 3 = $ 2; $ 2 = x} 1' sed的/ \ +/\ t/g'' –
awk '{ printf("%s %d %d\n",$1,($2 < $3) ? $2 : $3,($2 < $3) ? $3 : $2) }' file
這是一張牀單文件嗎？即使谷歌似乎並不現在。 –
牀文件是一張表格，其中包含基因組內DNA序列的座標。您可以使用它從基因組中提取序列，或者進行分析，如是否有基因，這些基因彼此接近或序列相互重疊。 – JadenBlaine