pygraphviz佈局IOerror

Question

我嘗試使用pygraphviz打印圖形。我運行下面的代碼並得到以下錯誤。 代碼：

import pygraphviz as pgv 

G=pgv.AGraph("k5_attributes.dot") 
G.layout(prog = 'neato') 
G.draw('file.png') 

錯誤：

Traceback (most recent call last): 
    File "./test.py", line 22, in <module> 
    G.layout(prog = 'neato') 
    File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pygraphviz/agraph.py", line 1359, in layout 
    data = self._run_prog(prog, ' '.join([args, "-T", fmt])) 
    File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pygraphviz/agraph.py", line 1336, in _run_prog 
    raise IOError(b"".join(errors)) 
IOError: /usr/bin/neato: Symbol `MemTest' has different size in shared  object, consider re-linking 

我安裝pydot，matplotlib，pygraphviz，numpy的，蟒蛇-devel的，cairocffi。

謝謝你，如果有人有什麼問題來自

Answer 1

該錯誤消息說，當程序運行起來/usr/bin/neato（特別/usr/bin/neato -Tpng ... NEATO有問題的想法。「NEATO」是「的graphviz」的一部分。

您可能能夠通過運行來驗證這一點：

neato -Tpng k5_attributes.dot -o example.png 

，你可能會得到同樣的消息：

Symbol `MemTest' has different size in shared  object, consider re-linking 

通常情況下，您可以通過卸載「graphviz」然後重新安裝來解決這個問題。這將導致事情重新鏈接。但爲了安全起見，我還要先卸載pygraphviz，然後在安裝「graphviz」後重新安裝。