Linux的：加入兩行相等的值在同一文件

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1 51 Brahui ACAAT
1 51 Brahui ACAGT
3 51 Brahui ACAGC
3 51 Brahui ACGAT
5 51 Brahui ACGAT
5 51 Brahui ACGGC
7 51 Brahui ACGAT
7 51 Brahui ACGGT
9 51 Brahui ACGGT
9 51 Brahui A C G G T

我想生成一個輸出文件，如果第一列/字段的值相等，那麼我想將兩行合併爲一個「/」字符作爲分隔符。例如：

1 51 Brahui A/AC/CA/AA/GT/T
3 51 Brahui A/AC/CA/GG/AC/T

有一種方法，我可以做到這一點？

P.S。從4美元起的列實際上是2,834美元（即$ 4-2841美元），所以我認爲實際輸入$ 4，$ 5，$ 6等是不實際的。有沒有辦法做到這一點？

來源

2012-04-03 714

爲什麼第5列=「C/A」？ – kev 2012-04-03 11:34:42

你使用什麼編程語言？ – 2012-04-03 16:20:21

我一直希望能夠在Linux中使用shell終端來完成此操作。但我也可以使用Perl – 714 2012-04-04 08:21:00

pearl.229>awk '{a=$1; 
      b=$4; 
      c=$5; 
      d=$6; 
      e=$7; 
      f=$8; 
      getline; 
      if(a==$1) 
      print a,$2,$3,b"/"$4,c"/"$5,d"/"$6,e"/"$7,f"/"$8}' file3 
    1 51 Brahui A/A C/C A/A A/G T/T 
    3 51 Brahui A/A C/C A/G G/A C/T 
    5 51 Brahui A/A C/C G/G A/G T/C 
    7 51 Brahui A/A C/C G/G A/G T/T 
    9 51 Brahui A/A C/C G/G G/G T/T 
    pearl.230>

來源

2012-04-03 11:31:51 Vijay

我喜歡用fmt。它使代碼更漂亮。

[[email protected] ~]$ cat doit 
#!/usr/bin/awk -f 

BEGIN { 
    fmt="%s %s %s %s/%s %s/%s %s/%s %s/%s %s/%s\n"; 
} 

one == $1 { 
    split(last,a); 
    printf(fmt, $1,$2,$3, a[4],$4, a[5],$5, a[6],$6, a[7],$7, a[8],$8); 
} 

{ last = $0; one = $1; } 

[[email protected] ~]$ ./doit input.txt 
1 51 Brahui A/A C/C A/A A/G T/T 
3 51 Brahui A/A C/C A/G G/A C/T 
5 51 Brahui A/A C/C G/G A/G T/C 
7 51 Brahui A/A C/C G/G A/G T/T 
9 51 Brahui A/A C/C G/G G/G T/T 
[[email protected] ~]$

來源

2012-04-03 11:43:32 ghoti

Linux的：加入兩行相等的值在同一文件

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