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我需要幫助啓動/編寫一個R腳本,它可以與另一個腳本文件交叉檢查一個.txt文件,以查找存在多個實例的位置。我有一個帶有一個miRNA列表的excel文件,我想與另一個包含相同miRNA名稱的列的Excel文件交叉引用。與R交叉檢查兩個文本文件
我需要幫助啓動/編寫一個R腳本,它可以與另一個腳本文件交叉檢查一個.txt文件,以查找存在多個實例的位置。我有一個帶有一個miRNA列表的excel文件,我想與另一個包含相同miRNA名稱的列的Excel文件交叉引用。與R交叉檢查兩個文本文件
那麼它是一個文本文件或Excel文件導入?沒有更多的細節,文件結構或可重複的例子,這將很難提供幫助。
你可以試試:
# Get the correct package
install.packages('readxl')
df1 <- readxl::read_excel('[directory name][file name].xlsx')
df2 <- readxl::read_excel('[directory name][file name].xlsx')
# Creates a new variable flag if miRNA from your first dataset is in the second dataset
df1$is_in_df2 <- ifelse(df1$miRNA %in% df2$miRNA, 'Yes', 'No')
我可以導入這兩種格式,我不認爲這會事。我目前有他們在Excel格式。基本上,我想要做的只是將第一個文件與miR名稱進行交叉檢查,然後指出哪個基因與miR名稱相關聯。 –