循環訪問目錄中的所有輸入並使用輸入名稱創建輸出目錄

Question

我有一個包含10個不同文件的目錄，我需要對所有文件運行相同的命令，但將結果保存在獨特的獨立目錄中與我的輸入文件名稱作爲結果目錄名稱。據我所知，我的問題是類似Looping through all the inputs and creating distinct output files，所以我嘗試了下面的代碼：

cd /user/test 

for i in *.txt 
do 
    fastqc $i -o {$i}.out 
done 

我得到一個錯誤：

Specified output directory '{1.txt}.out' does not exist 
Specified output directory '{2.txt}.out' does not exist 

我在想，可能是什麼問題，因爲這將是有益的同時創建管道和工作流程。 謝謝！

Answer 1

我喜歡用find這是有用的，如果你的文件在嵌套目錄：

find /user/test -name '*.txt' -exec fastqc "{}" -o "{}.out" \; 

find將執行-exec所有.txt文件後指定的命令在/用戶/試驗發現（搜索是遞歸的）。

Answer 2

你有{和}外，你需要使用：

cd /user/test  
for i in *.txt; do 
    fastqc "$i" -o "${i}.out" 
done 

或者只是：

for i in *.txt; do 
    fastqc "$i" -o "$i.out" 
done 

由於DOT不被認爲是變量名稱的一部分。