的選項和參數shell腳本 - 基於以下解決方案更新

Question

，我想出了這個能夠接受-q或-a作爲選項，都與參數：

> #!/bin/bash 
> 
> input_file="${1:-/dev/stdin}" 
> 
> while getopts ":qa:" opt; do case $opt in 
> 
>  q) 
>  string="$OPTARG" 
>  echo "org = $string" 
>  grep -v '^>' "$input_file" | grep -x '.\{15,30\}' | sort | uniq -c | awk '{print $2, $1}' | perl -lane ' print ">dme" . $n++ . "_count=$F[1]\n$F[0]" if ($F[1] > 2) '  
>  ;; 
> 
>  a) 
>  string="$OPTARG" 
>  echo "org = $string" 
>  grep -v '^>' "$input_file" | grep -x '.\{15,30\}' | sort | uniq -c | awk '{print $2, $1}' | perl -lane ' print ">dme" . $n++ . "_count=$F[1]\n$F[0]" if ($F[1] > 2) ' 
>  ;; 
> 
>  \?) 
>  echo "Invalid option: -$OPTARG" >&2 
>  exit 1 
>  ;; 
>  :) 
>  echo "Option -$OPTARG requires an argument." >&2 
>  exit 1 
>  ;; esac done 

./script.sh -q "hsa" < test.txt > trial.txt

誠如，我拿出選項-m。目前，我對選項q和m有相同的說明，僅用於測試目的。選擇一個作品併產生期望的結果。選項q不會引發錯誤，但不會產生相同的結果。

此外，我想從命令行提供的參數傳遞給perl指令，即我想dme被替換爲命令行提供的任何內容。有沒有辦法做到這一點？現在，perl行運行良好。

謝謝！

Answer 1

嘗試使用bash，這是第一個註釋後更改

#!/bin/sh 

到

#!/bin/bash 

補充：

#!/bin/bash 

input_file="${1:-/dev/stdin}" 

#a and q do not have arguments and are interchangeable, option m accepts a three letter string 
while getopts ":qam:" opt; do 
    case $opt in 
    q) 
     echo "-q was triggered" #, Parameter: $OPTARG" >&2 
     #awk "$input_file" '{print $2, $1}' | perl -lane ' print ">one" . $n++ . "_count=$F[1]\n$F[0]" if ($F[1] > 2) ' > output1.txt 
     ;; 
    a) 
     #perl -lane ' print ">one" . $n++ . "_count=$F[1]\n$F[0]" if ($F[1] > 2) ' < "$input_file" > output1.txt 
     echo "-a was triggered" 
     ;; 
    m) 
     echo "-m was triggered, Parameter: $OPTARG" >&2 
     string="$OPTARG" 
     if [ ${#string} = 3 ]; then 
     echo "string $string has length 3! good" 
     else 
     echo "string $string should be of length 3!" 
     exit 
     fi 
     ;; 
    \?) 
     echo "Invalid option: -$OPTARG" >&2 
     exit 1 
     ;; 
    :) 
     echo "Option -$OPTARG requires an argument." >&2 
     exit 1 
     ;; 
    esac 
done 

檢查，我沒有從原始忘記任何事情碼。據我知道你不能調用帶有>的劇本你的選擇之間，但你可以這樣做：

./script.sh -a -q -m "one" -X < test.html 
-a was triggered 
-q was triggered 
-m was triggered, Parameter: one 
string one has length 3! good 
Invalid option: -X 

注意，X是一個無效的選項。

編輯 Andy G更新了他的問題： 您需要更改getopts。如果需要，請檢查文檔：或:: q和a之後。

while getopts ":q:a:" opt; do 

關於perl問題：你能試試嗎？

perl -lane ' print > "$string" . $n++ . "_count=$F[1]\n$F[0]" if ($F[1] > 2) '