追加行上一行

我想追加與>開始前行未開頭的所有行>追加行上一行

cat tmp 

ATAAACGGAAAAACACTACTTTAGCTTACGGGATCCGGT 
>Aa_816 
>Aa_817 
>Aa_818 
CCAAACGGAAAAACACTACTTGAGCTTACGGGATCCGGT 
>Aa_940 
>Aa_941 
CTAAAAGGAAAAACACTACTTTAGCTTTTGGGATCCGGT

我想是這樣的：

ATAAACGGAAAAACACTACTTTAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_816 >Aa_817 >Aa_818 
CCAAACGGAAAAACACTACTTGAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_940 >Aa_941 
CTAAAAGGAAAAACACTACTTTAGCTTTTGGGATCCGGT

這幾乎讓我有：

cat tmp |awk '!/>/ {sub(/\\$/,""); getline t; print $0 t; next}; 1'

來源

2014-02-19 Ashley

awk '/^[^>]/ { if (length(old) > 0) print old; old = $0 } 
    /^>/ { old = old " " $0 } 
    END  { if (length(old) > 0) print old }'

來源

2014-02-19 21:54:01

隨着awk：

awk '!/^>/{printf "%s%s", (NR==1)?"":RS,$0;next}{printf "%s", FS $0}END{print ""}' file

來源

2014-02-19 22:00:29

你應該總是提供printf的格式說明：'printf的「％s％S」，（NR == 1）？「」：RS，$ 0'和'printf「％s」，FS $ 0' - 如果要打印的字符串包含％-directives，這可以保護您。 –

謝謝@glennjackman。你說得對，我已經更新了答案。 –

用awk

awk '!/>/{printf (NR==1)?$0:RS $0;next}{printf FS $0}' file

如果你不在乎輸出具有第一線產生的新的生產線，這裏是一個短。

awk '{printf (/>/?FS $0:RS $0)}' file

來源

2014-02-19 23:20:11 BMW

我認爲，所有你需要的是一點點sed：

sed ':a; N; $!ba; s/\n>/ >/g' file

結果：

ATAAACGGAAAAACACTACTTTAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_816 >Aa_817 >Aa_818 
CCAAACGGAAAAACACTACTTGAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_940 >Aa_941 
CTAAAAGGAAAAACACTACTTTAGCTTTTGGGATCCGGT

來源

2014-02-20 04:56:46 Steve

+1爲邏輯。 – BMW

追加行上一行

回答

相關問題