篩選基於特定的列一個大文件在bash

我有>百米行的文件，並希望通過一些標準對其進行過濾：篩選基於特定的列一個大文件在bash

$ wc -l s1bam.bed 
104797540 s1bam.bed 

$ head -n 3 s1bam.bed 
chr1 14688 14979 NB501800:50:H3NW5BGX3:2:22310:19560:5036/1 3 + 
chr1 14688 14979 NB501800:50:H3NW5BGX3:3:13501:3458:17919/1 3 + 
chr1 14727 15018 NB501800:50:H3NW5BGX3:2:22310:19560:5036/2 3 -

我想輸出什麼是第五個字段值>=20和!=255（例如右邊的第二個字段）。如何在Bash中實現它？

來源

2017-07-20 David Z

很好的解釋，但本質上所示着力解決的主要問題......問題的標題的精確搜索提供了大量的提示使用'awk' ... – Sundeep

您可以用awk此：

awk '$5 >= 20 && $5 != 255' file

來源

2017-07-20 14:31:27 anubhava

謝謝@anubhava！ –

再次感謝您！我想知道是否有一個簡單的方法來表格$ 5字段並在終端中打印出來，以便我可以選擇一個好的截止點。 –

如果你想僅在上述條件下打印'$ 5'，那麼使用：awk'$ 5> = 20 && $ 5！= 255 {print $ 5}'file'如果你不想要任何條件，那麼就使用'awk' {print $ 5}'文件' – anubhava

篩選基於特定的列一個大文件在bash

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