roxygen2

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如何在通過「.R」 - >（roxygen2）「.Rd」 - >（R CMD檢查mypackage）「.PDF」創建的.PDF文件中的文本中插入空格。

我已經通過「.R」 - >（roxygen2）「.Rd」 - >（R CMD檢查mypackage）「.PDF」創建了許多.PDF文件。現在，我想在包的.PDF文件（mypackage的-手冊.pdf）添加表格模板： Table: ADF Statistics of the Raw Variables ----------------------------------------------

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添加章節至R包的幫助/文檔

一些R包他們的幫助/文檔和鏈接到那些部分酒吧中（例如，ggplot2，dplyr，devtools等）已按字母順序有權段（由下圖紅色箭頭所示）。其他包（例如，RcmdrMisc）沒有。如何將這些元素添加到可能的R軟件包的幫助中？我用roxygen2的文檔。

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使用RStudio的閃亮應用程序的功能自動文檔化

我正在開發一個閃亮的應用程序，並得到一個點比我預期的功能更多。我計劃開始使用testthat進行自動化測試，我很樂意使用roxygen2來記錄我的功能。由於我使用RStudio，我開始了一個新的閃亮的應用程序項目。現在我想知道，因爲我想完成文檔和測試，如果我應該在RStudio中啓動包以獲取所有devtools函數。我想知道，如何獲得正確記錄的功能，並在build像測試的例子。另外使用test

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R：roxygen2，導入的包不會出現在命名空間

我有一個文件：import_packages.r在我的項目，包含以下內容： #' @import reshape2 #' @import ggplot2 #' @import DESeq2 #' @import geneplotter #' @import survcomp #' @import gplots #' @import pheatmap #' @import RColor

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從R包手冊中排除功能

我正在編寫一個R包，並且正在用roxygen2記錄我所有的功能。但是，我不希望所有功能都出現在軟件包的手冊中。如何指定哪些功能應該出現在包裝手冊中，或哪些不應該出現？我知道用一個前導點命名一個函數，例如， .f <- function()而不是f <- function()是一個解決方案。還有其他解決方案嗎？

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Markdown並勾勒出一個R腳本

我正在使用Emacs的R腳本使用氧氣評論進行降價。隨着rmarkdown :: render（）我產生一個HTML或PDF文件。很棒。但是，如果我可以在此文件中使用大綱模式作爲標題（顏色不同並摺疊或顯示內容），那將會很棒。我搜索了互聯網，但還沒有找到解決方案，如何使這項工作。一個例子是（R-文件）： #' # Heading 1 #' some test t <- c(1,2) #' #

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使用devtools爲R包創建主要幫助頁面（索引）

我正在使用devtools構建R包。所有文檔均使用roxygen2構建。對於這些功能這一切都很好，但我怎樣才能爲整個軟件包提供一個幫助頁面，其中列出了所有可用的功能。在其他包總是有每個幫助頁面底部的鏈接，導致索引頁： Screenshot from dplyr package (exemplary index link) 我怎樣才能建立/鏈路與devtools此索引頁？編輯：如果我通過「？fu

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Rstudio沒有生成.Rd文件

我已經使用Rstudio創建了一個R包幾個月。我只需要選擇File-> New Project - > New Directory - > R軟件包，然後在指定項目名稱後將R文件添加到項目中。當我點擊「創建項目」時，會生成帶有.Rd文件的R包結構。但由於某種原因，這不會發生。包結構已創建，但man目錄爲空，並且沒有.Rd文件。注意：當我之前完成此操作時，我沒有包含任何roxygen註釋來生成.R

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爲什麼roxygen2不會自動更新DESCRIPTION文件中的「Imports」？

我正在密切關注@ hadley的book以瞭解編寫R軟件包的最佳實踐。我很高興看到這些關於philosophy的書：任何可以自動化的東西都應該是自動的。只需手動操作，即可儘量少用。儘可能多地使用功能。所以，當我在閱讀有關的依賴和（在某種程度上）命名空間中的文件導入指令和「進口」之間的混淆不同領域的說明文件，我希望roxygen2會自動處理兩者的他們。 After all 在NAMESPACE

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如何在編寫包時指定依賴關係？

我想寫一個包含一些依賴關係的包。我能夠使用library()手動加載依賴關係，但我希望它們能夠與我的包一起自動加載。我認爲DESCRIPTION文件上的屬性Imports可以用於這項工作，但它不適用於我。所以我從頭開始一個完全新的會話： sessionInfo() R version 3.3.0 (2016-05-03) Platform: x86_64-apple-darwin13.4