在Fedora 17上安裝python-igraph-0.6模塊

Question

我嘗試了一段時間來爲我的EPD-python安裝python-igraph-0.6模塊。 我建C芯，和各種網站上的指令之後我做的：

/home/joseph/epd/bin/python setup.py build 

或

/home/joseph/epd/bin/python setup.py install 

，它始終生成相同的錯誤：

error: command 'gcc' failed with exit status 1 

我會必須可能的解釋：'gcc'工作不正常（但我已經用./configure，make，make install編譯了C部分），或者某種東西沒有正確鏈接。 我已經看過類似的帖子和安裝python-devel軟件包等等...... 但沒有任何改變。

完整的輸出是：

[root@joseph python-igraph-0.6]# /home/joseph/epd/bin/python setup.py build 
Using default include and library paths for compilation 
If the compilation fails, please edit the LIBIGRAPH_FALLBACK_* 
variables in setup.py or include_dirs and library_dirs in 
setup.cfg to point to the correct directories and libraries 
where the C core of igraph is installed 
() 
Include path: /usr/include /usr/local/include 
Library path: 
running build 
running build_py 
running build_ext 
building 'igraph._igraph' extension 
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -O2 -fPIC -I/usr/include  -I/usr  /local /include -I../../build/include -I../../include -I/usr/local /include -I/usr/include -I/home/joseph/epd/include/python2.7 -c src/common.c -o  build/temp.linux-x86_64-2.7/src/common.o 
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -O2 -fPIC -I/usr/include -I/usr/local/include -I../../build/include -I../../include -I/usr/local/include -I/usr/include -I/home/joseph/epd/include/python2.7 -c src/arpackobject.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/arpackobject.o 
In file included from src/arpackobject.c:23:0: 
src/arpackobject.h:27:27: fatal error: igraph_arpack.h: No such file or directory 
compilation terminated. 
error: command 'gcc' failed with exit status 1 

Answer 1

你所得到的錯誤消息表明編譯器無法找到綁定到的igraph的C-核心所需的標題。特別是它缺少一個名爲igraph_arpack.h的文件，但這不是唯一的一個，會有更多的gcc在此消息後繼續編譯。

setup.py igraph的Python界面腳本依賴於pkg-config來找出在哪裏可以找到標題，但是在你的系統中這會失敗，可能是因爲pkg-config本身沒有安裝。所以，我想該解決方案如下：

1. 確保你已經編譯的C核心後運行make install。你聲稱你是這麼做的，但爲了完整性，我想我會提到它。

2. 在您的系統上安裝pkg-config。

3. 檢查pkg-config是否通過輸入pkg-config --cflags --libs igraph來了解igraph的安裝C核。如果你看到一些打印到標準輸出的編譯器選項，你沒問題。

4. 再次運行python setup.py install。這次它應該成功調用pkg-config，獲取所需的編譯器選項，併成功編譯Python接口。

如果仍然無法正常工作（例如，因爲你不能讓pkg-config工作），你可以打開setup.cfg和編輯include_dirs和library_dirs變量;前者應指向包含igraph文件的文件夾（通常爲/usr/local/include/igraph或/usr/include/igraph，具體取決於您安裝C核的位置），後者應指向libigraph.so所在的文件夾。