-2
我需要根據另一個文件中包含的映射合併兩個文件。因此,在下面的示例中,將file1與file2結合,其中file1中的第2列與file3中的第2列匹配,並且file2中的第2列與file3中的第4列匹配。根據第三個文件中的映射合併兩個文件
優選地,其利用UNIX程序諸如AWK等的溶液
file1的:
Scf_3L 12798910 T 0 41 0 0 NA NA
Scf_3L 12798911 C 0 0 43 0 NA NA
Scf_3L 12798912 A 42 0 0 0 NA NA
Scf_3L 12798913 G 0 0 0 44 NA NA
Scf_3L 12798914 T 0 42 0 0 NA NA
Scf_3L 12798915 G 0 0 0 44 NA NA
Scf_3L 12798916 T 0 42 0 0 NA NA
Scf_3L 12798917 A 41 0 0 0 NA NA
Scf_3L 12798918 G 0 0 0 43 NA NA
Scf_3L 12798919 T 0 43 0 0 NA NA
Scf_3L 12798920 T 0 41 0 0 NA NA
file2的:
3L 12559896 T 0 31 0 0 NA NA
3L 12559897 C 0 0 33 0 NA NA
3L 12559898 A 34 0 0 0 NA NA
3L 12559899 G 0 0 0 33 NA NA
3L 12559900 T 0 34 0 0 NA NA
3L 12559901 G 0 0 0 33 NA NA
3L 12559902 T 0 33 0 0 NA NA
3L 12559903 A 33 0 0 0 NA NA
3L 12559904 G 0 0 0 33 NA NA
3L 12559905 T 0 34 0 0 NA NA
3L 12559906 T 0 33 0 0 NA NA
file3的:
3L 12798910 T 12559896 T
3L 12798911 C 12559897 C
3L 12798912 A 12559898 A
3L 12798913 G 12559899 G
3L 12798914 T 12559900 T
3L 12798915 G 12559901 G
3L 12798916 T 12559902 T
3L 12798917 A 12559903 A
3L 12798918 G 12559904 G
3L 12798919 T 12559905 T
3L 12798920 T 12559906 T
輸出:
Scf_3L 12798910 T 0 41 0 0 NA NA 3L 12559896 T 0 31 0 0 NA NA
Scf_3L 12798911 C 0 0 43 0 NA NA 3L 12559897 C 0 0 33 0 NA NA
Scf_3L 12798912 A 42 0 0 0 NA NA 3L 12559898 A 34 0 0 0 NA NA
Scf_3L 12798913 G 0 0 0 44 NA NA 3L 12559899 G 0 0 0 33 NA NA
Scf_3L 12798914 T 0 42 0 0 NA NA 3L 12559900 T 0 34 0 0 NA NA
Scf_3L 12798915 G 0 0 0 44 NA NA 3L 12559901 G 0 0 0 33 NA NA
Scf_3L 12798916 T 0 42 0 0 NA NA 3L 12559902 T 0 33 0 0 NA NA
Scf_3L 12798917 A 41 0 0 0 NA NA 3L 12559903 A 33 0 0 0 NA NA
Scf_3L 12798918 G 0 0 0 43 NA NA 3L 12559904 G 0 0 0 33 NA NA
Scf_3L 12798919 T 0 43 0 0 NA NA 3L 12559905 T 0 34 0 0 NA NA
Scf_3L 12798920 T 0 41 0 0 NA NA 3L 12559906 T 0 33 0 0 NA NA
您選擇了合適的工具('awk')。向我們展示你的努力? – sat
這似乎不是一個問題,只是尋找工作解決方案 – frmi