如何在R中讀取linux進程狀態（ps）命令的輸出？

這裏是data.txt中：如何在R中讀取linux進程狀態（ps）命令的輸出？

USER  PID %CPU %MEM VSZ RSS TTY  STAT START TIME COMMAND 
root   1 0.0 0.0 2280 728 ?  Ss 20:44 0:00 init [2]  
root   2 0.0 0.0  0  0 ?  S 20:44 0:00 [kthreadd] 
root  202 0.0 0.0  0  0 ?  S< 20:44 0:00 [ext4-dio-unwri 
root  334 0.0 0.1 2916 1452 ?  Ss 20:44 0:00 udevd --daemon

如何將數據讀入一個data.frame？
1.可沒有來決定分離器
最後場是一個問題，space不能分離，
INIT [2]，udevd會--daemon是一個字段，不能由space分離。
2.no固定寬度
每行都有不同的寬度。

那麼，我怎樣才能將data.txt讀入data.frame？

來源

2013-01-21 it_is_a_literature

你肯定沒有固定的寬度在這裏？這似乎是固定的寬度，除了最後一列。 – A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1

我可以通過'read.fwf（「data.txt」，widths = c（4，10，5，5，7，6，4，10，6，7，20 ），skip = 1）'。無法使標題正常工作，這就是爲什麼我有'skip = 1'，但這些很容易添加。最後一個寬度可以設置得比您期望的大得多，您應該沒問題...我想。 ... – A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1

@AnandaMahto - 我認爲使用'read.fwf'將會產生問題，因爲用於生成此文本的'ps' linux命令在每次運行時都會使用不同大小的列，這取決於需要打印的值。我在下面評論說，使用該程序時可以手動指定輸出格式。 – thelatemail

你的數據格式是什麼？如果您可以在Excel中打開它，並將其保存爲製表符分隔文件，這很可能是繼續前進的最佳方式。

將文件保存爲製表符分隔文件是準備導入R的數據的更常用方法之一。這可以通過'保存爲''.txt（製表符已刪除）'在Excel中完成。一旦做到這一點：

my_data <- read.table("path/to/file/", header = TRUE, sep = "\t")

sep = "\t"告訴[R，你的文件標籤deliminated

來源

2013-01-21 03:29:06 Sam

請在linux'ps aux中使用命令'，你可以得到格式文件，'\ t'不能在這裏使用。 –

@KillKill - 如何將'ps aux'重定向到csv可能值得看這個問題：http://stackoverflow.com/questions/3114741/generating-a-csv-list-from-linux-ps Looking在'man ps'你可以指定輸出格式。 – thelatemail

我會做這樣的：

library(stringr) # has a convenient function for splitting to a fixed length 

raw   <- system("ps aux", intern = TRUE) 
fields  <- strsplit(raw[1], " +")[[1]] 
ps   <- str_split_fixed(raw[-1], " +", n = length(fields)) 
colnames(ps) <- fields

來源

2013-01-21 12:47:42 flodel

太棒了，避免了任何外部文件 - I/O！ 'raw'是一個R內建函數，最好不要影響它，而是將變量'out'調用。 – smci

這裏是一個班輪應該做的伎倆：

do.call(rbind, lapply(strsplit(readLines("data.txt"), "\\s+"), function(fields) c(fields[1:10], paste(fields[-(1:10)], collapse = " "))))

這就是它在細節：

經由readLines（在字符向量的結果，其中每個向量元素是文件的一行）
使用strsplit分割各行成由空格分隔strigs讀取的文件中的所有行（\\s+ ）
爲每個線（lapply），合併，落入本領域10後成一個（經由paste(..., collapse = " ")所有字段）---這產生，其中每個列表元素表示文件的一行，併爲字符向量的列表長度爲11（每場一個）
最後調用rbind到列表合併成一個矩陣（或數據幀）

來源

2013-04-07 10:15:33 QkuCeHBH

如何在R中讀取linux進程狀態（ps）命令的輸出？

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