從matlab中的鄰接矩陣創建圖

Question

我在matlab中有一個鄰接矩陣。我如何繪製圖表？由於我有> 500個節點，因此我不能使用隨機（或網格狀）座標的gplot。

Answer 1

退房此功能：gplot

例子：

% Plot half of a "Bucky ball" carbon molecule, placing asterisks at each node: 
k = 1:30; 
[B,XY] = bucky; 
gplot(B(k,k),XY(k,:),'-*') 
axis square 

Answer 2

因此，假如你有bioinformatics toolbox，該biograph功能是完美的，你想要做什麼。

這是我在過去所做的那樣：

假設from和to都包含關於兩個向量的到從系統中的節點。然後，您可以創建鄰接矩陣是這樣的：

Sys = sparse(from,to,1,s,s); 
Adj_mat = tril(Sys + Sys'); 

我假設你已經有你的鄰接矩陣adj_mat，在這種情況下，所有你需要做的是：

bg = biograph(Adj_mat,[],'ShowArrows','off','ShowWeights','off'); 
h = view(bg); 

我增加了一些論點只是爲了說明一些可能性。我想要箭頭，跳過那部分。

節點將根據「最低能量」標準默認放置，這意味着「分支交叉點」的數量被最小化。佈局可以更改，例如添加'LayoutType','Radial'。

查看documentation瞭解更多信息。

這是我之前使用biograph創建的示例。使邊緣平直很簡單，或者爲分支分配不同的顏色和重量。另外，您可以爲節點創建不同的名稱，或者刪除名稱，只需要有一個「點」。

編輯

的回答爲文森特的問題的意見：

我以前set(edges,'LineWidth',1.5)來設定邊緣的權重。查看一些額外的文檔和示例here。

%% Color affected lines: 
set(h.nodes(nn),'Color',[0.2 0.8 0.2]); 
fowEdges = getedgesbynodeid(h,get(h.Nodes(nn),'ID')); 
revEdges = getedgesbynodeid(h,get(h.Nodes(fliplr(nn)),'ID')); 
edges = [fowEdges;revEdges]; 
set(edges,'LineColor',[0.2 0.8 0.2]) 
set(edges,'LineWidth',1.5) 

%% Color faulted line: 
set(h.nodes(newFaultNodes),'Color',[1 0.4 0.4]); 
fowEdges = getedgesbynodeid(h,get(h.Nodes(newFaultNodes),'ID')); 
revEdges = getedgesbynodeid(h,get(h.Nodes(fliplr(newFaultNodes)),'ID')); 
edges = [fowEdges;revEdges]; 
set(edges,'LineColor',[1 0 0]) 
set(edges,'LineWidth',2)