2014-12-27 54 views
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我是新來這個論壇和新的計算分析,我使用的是獨立的NCBI BLAST +(BLASTP)的第一次,我有以下格式結果文件:教程:高爐+成果文件解析到FASTA文件

查詢= Y

長度= 6

主題= X

長度= 739

分數= 15.4位(28),期望值= 0.044,方法:基於構圖的統計。 同一性= 5/6(83%),陽性值= 6/6(100%),間隙= 0/6(0%)

查詢1 DDDIPF 6 d + DIPF Sbjct 244 DNDIPF 250

但我想要做的所有命中的多重比對,對,我需要提取序列如下齋戒格式:

主題= X

Sbjct 244 DNDIPF

是否有任何工具有助於從blast結果文件或工具/教程中直接進行多重比對,以提取fasta格式的序列以進一步處理。謝謝。

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更好的請訪問https://www.biostars.org/ – efrem

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如果你想使用爆炸的直接輸出,你可以使用MView,重新格式化序列數據庫搜索的結果。 否則另一種選擇是提取您感興趣的序列的ID並執行對齊以獲得另一個工具(例如肌肉)