checkCompilerOptions安裝軟件包時出錯（小問題/ Docker）

在最後一行，this Docker文件調用littler::install.r來安裝RcppRcppEigen和matrixStats。checkCompilerOptions安裝軟件包時出錯（小問題/ Docker）

整個代碼是工作就像一個魅力幾個月回來。現在，它在最後一步轟炸了。更確切地說，Rcpp和RcppEigen仍然安裝完美的，但是當涉及到安裝matrixStats，我得到：

installing to /usr/local/lib/R/site-library/matrixStats/libs 
** R 
** inst 
** byte-compile and prepare package for lazy loading 
** help 
*** installing help indices 
** building package indices 
** installing vignettes 
** testing if installed package can be loaded 
Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) : 
    object 'checkCompilerOptions' not found 
Calls: ::: -> get 
Execution halted 
ERROR: loading failed 
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/matrixStats’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages(f, lib, if (isMatchingFile(f)) NULL else repos) : 
    installation of package ‘matrixStats’ had non-zero exit status

這是一個錯誤之前，我從來沒有和有麻煩定位在那裏，甚至來自哪裏。什麼可能導致這個問題？任何信息已經有很大幫助。

來源

2016-01-27 user189035

由@插孔wasey下面說明當使用'從RDevel install.packages'但是，使用R – amc

從我的頭頂我會責備在matrixStats [但看下面，它似乎無可指責]的變化 - 我有點熟悉所有其他運動部件，並沒有意識到變化或錯誤。

有一點是腥雖然是尾隨換行符：

RUN install.r Rcpp RcppEigen matrixStats \

您可以嘗試沒有它。

編輯：而對於什麼是值得我只是通過

docker run --rm -ti r-base /bin/bash

解僱了我們的標準基層泊塢窗圖像r-base和調用

install.r Rcpp RcppEigen matrixStats

其執行就好了。

所以，如果sonething是不對的其他泊塢容器，你可能不得不採取它與它的作者，並通過他的變化相對於我們Dockerfile他似乎已經習慣作爲基礎工作。

來源

2016-01-30 18:22:13

超級不影響安裝，這也是一個問題！感謝所有這些 – user189035

然而，使用搖桿/ R-devel的R-devel的，

docker run --rm -ti rocker/r-devel /bin/bash

RD

install.packages("matrixStats")

給出了同樣的錯誤。我猜這是另一個R-devel的變化，其帶走的東西都取爲之前理所當然的，在這種情況下是與compiler包。然而，我還沒有解決方案。剛（重新）安裝或安裝compiler沒有幫助。

更新

使用R CMD INSTALL --no-byte-compile允許backports安裝對我來說，這是我遇到的麻煩的包。

來源

2016-03-26 18:12:02

checkCompilerOptions安裝軟件包時出錯（小問題/ Docker）

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