服務器崩潰後恢復損壞的neo4j數據庫graphdb.NotFoundException

Question

我有一個neo4j數據庫，其中有數百萬個節點，並且關係數目也一樣多。在運行一個正在向其中添加數據的程序時，JVM似乎崩潰了。當我後來試圖使用索引來查詢數據庫，它常開和檢索的一些節點，但在某些時候返回以下錯誤：

Exception in thread "main" org.neo4j.graphdb.NotFoundException: Node[20924] not found. This can be because someone else deleted this entity while we were trying to read properties from it, or because of concurrent modification of other properties on this entity. The problem should be temporary. at org.neo4j.kernel.impl.core.Primitive.ensureFullProperties(Primitive.java:601) at org.neo4j.kernel.impl.core.Primitive.ensureFullProperties(Primitive.java:579) at org.neo4j.kernel.impl.core.Primitive.hasProperty(Primitive.java:309) at org.neo4j.kernel.impl.core.NodeImpl.hasProperty(NodeImpl.java:53) at org.neo4j.kernel.impl.core.NodeProxy.hasProperty(NodeProxy.java:160) at org.neo4j.cypher.internal.spi.gdsimpl.GDSBackedQueryContext$$anon$1.hasProperty(GDSBackedQueryContext.scala:66) at org.neo4j.cypher.internal.spi.gdsimpl.GDSBackedQueryContext$$anon$1.hasProperty(GDSBackedQueryContext.scala:48) at org.neo4j.cypher.internal.commands.Has.isMatch(Predicate.scala:203) at org.neo4j.cypher.internal.pipes.FilterPipe$$anonfun$internalCreateResults$1.apply(FilterPipe.scala:30) at org.neo4j.cypher.internal.pipes.FilterPipe$$anonfun$internalCreateResults$1.apply(FilterPipe.scala:30) at scala.collection.Iterator$$anon$14.hasNext(Iterator.scala:390) at scala.collection.Iterator$class.foreach(Iterator.scala:727) at scala.collection.AbstractIterator.foreach(Iterator.scala:1156) at org.neo4j.cypher.internal.pipes.EagerAggregationPipe.internalCreateResults(EagerAggregationPipe.scala:76) at org.neo4j.cypher.internal.pipes.PipeWithSource.createResults(Pipe.scala:69) at org.neo4j.cypher.internal.pipes.PipeWithSource.createResults(Pipe.scala:66) at org.neo4j.cypher.internal.executionplan.ExecutionPlanImpl.org$neo4j$cypher$internal$executionplan$ExecutionPlanImpl$$prepareStateAndResult(ExecutionPlanImpl.scala:164) at org.neo4j.cypher.internal.executionplan.ExecutionPlanImpl$$anonfun$getLazyReadonlyQuery$1.apply(ExecutionPlanImpl.scala:139) at org.neo4j.cypher.internal.executionplan.ExecutionPlanImpl$$anonfun$getLazyReadonlyQuery$1.apply(ExecutionPlanImpl.scala:138) at org.neo4j.cypher.internal.executionplan.ExecutionPlanImpl.execute(ExecutionPlanImpl.scala:38) at org.neo4j.cypher.ExecutionEngine.execute(ExecutionEngine.scala:72) at org.neo4j.cypher.ExecutionEngine.execute(ExecutionEngine.scala:67) at org.neo4j.cypher.javacompat.ExecutionEngine.execute(ExecutionEngine.java:66) at querygraph.BasicStatsQueries.main(BasicStatsQueries.java:54) Caused by: org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.InvalidRecordException: PropertyRecord[11853043] not in use at org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.PropertyStore.getRecord(PropertyStore.java:453) at org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.PropertyStore.getLightRecord(PropertyStore.java:306) at org.neo4j.kernel.impl.nioneo.xa.ReadTransaction.getPropertyRecordChain(ReadTransaction.java:185) at org.neo4j.kernel.impl.nioneo.xa.ReadTransaction.loadProperties(ReadTransaction.java:215) at org.neo4j.kernel.impl.nioneo.xa.ReadTransaction.nodeLoadProperties(ReadTransaction.java:239) at org.neo4j.kernel.impl.persistence.PersistenceManager.loadNodeProperties(PersistenceManager.java:111) at org.neo4j.kernel.impl.core.NodeManager.loadProperties(NodeManager.java:833) at org.neo4j.kernel.impl.core.NodeImpl.loadProperties(NodeImpl.java:143) at org.neo4j.kernel.impl.core.Primitive.ensureFullProperties(Primitive.java:596) ... 23 more

世界上只有一個線程（至少，我開始）運行查詢，它全部是閱讀，而不是寫作。雖然例外聲稱它是暫時的，但每次嘗試查詢此索引時都會發生這種情況。因此，我認爲它與壞的關機有關。在執行代碼以防止這種情況發生之前，我之前已經強制關閉了數據庫，但是neo4j始終能夠恢復數據庫，儘管它需要一段時間。看起來這更糟糕。

當我手動打開索引並添加try-catch時，它開始爲索引中的每個節點返回上面列出的錯誤。這是否意味着所有這些節點都不存在或損壞？這意味着數據的重大（巨大）損失，因爲索引中應該有大約一百萬個節點。我能做些什麼來恢復數據庫？

我使用的是1.9.2，並希望升級爲使用標籤等，但我現在需要這個數據庫來進行一些時間關鍵的工作，並且現在沒有時間來改變任何重要的東西。

非常感謝您的幫助。

Answer 1

對不起，發生在你身上。 :(什麼樣的崩潰是什麼？

我會建議做數據庫的備份，然後刪除並重新創建索引。

當你不能刪除索引程序也可以刪除 /data/graph.db/index/lucene/node/<indexname>下的目錄當數據庫關閉

然後事後你可以通過編程方式重新索引使用

您的節點（節點n：GlobalGraphOperations.at（DB）.getAllNodes（））{ 如果（node.hasProperty（ 「key」）） db.index（）。forNodes（「index」）。add（node，「key」，node.getProperty（「key」））; }

如果您能爲我們提供數據庫進行分析，那將是非常棒的。 非常感謝