list.files錯誤（？易）[R]

Question

我試着去r.bind在某些​​目錄中，在R上的下面的代碼中的所有文件（所有文件的格式相同）：

gene_list <- list.files("/nethome/genelist/") 
gene_CH <- do.call("rbind",lapply(gene_list, FUN=function(files) 
     {read.table(files, header=TRUE, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE)})) 
write.table(gene_CH,"/nethome/genelist/all.genes.CH_v2t.txt",sep="\t",quote=F,row.names=F) 

然而，我收到以下錯誤：

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection 
In addition: Warning message: 
In file(file, "rt") : 
    cannot open file 'A2ML1_v2t.txt': No such file or directory 

問題是，A2ML1_v2t.txt在目錄中。另外，更令人費解的是（對我來說）是今天早上這個代碼工作。但由於某種原因，它現在不工作。

有什麼建議嗎？

Answer 1

兩種可能性：

1. 今天上午，你的工作目錄是/ nethome/genelist /，但現在，事實並非如此。 list.files()只提供文件名，而不是絕對路徑，所以你的第二行將搜索當前工作目錄。請嘗試getwd()檢查，然後setwd()更改它。
2. 你在目錄中有讀權限，是嗎？