FSL（tbss）randomise命令不作任何置換

Question

我正在TBSS FSL上進行3組ANOVA，每組有20個主題。爲了分析我的樣本，我必須執行一個隨機命令，它基本上在我的樣本中進行排列。

的命令如下：

randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -f design.fts –e design.grp --T2 

其中design.mat矩陣是哪些屬性的不同組內的受試者矩陣，所述design.con是對比度的組之間計算比較矩陣，而.fts和.grp是進行方差分析所需的文件，由fsl內的GLM接口給出。

我的問題是，FSL實際上做沒有排列...

Data loaded 
1 permutations required for exhaustive test of f-test 1 
Doing all 1 unique permutations 
Starting permutation 1 (Unpermuted data) 
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_fstat1 is: 6.3312e+06 

我只是告訴你什麼是我所期望的，當我在做t檢驗無方差分析，該命令是以下幾點：

randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -n 500 --T2 

和終端的回答是：

Data loaded 
1.10355e+34 permutations required for exhaustive test of t-test 1 
Doing 500 random permutations 
Starting permutation 1 (Unpermuted data) 
Starting permutation 2 
Starting permutation 3 
... 
Starting permutation 500 
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_tstat1 is: 341255 

它看起來像如果程序itsel計算f所需的排列數量並找到1.儘管如此，我試圖通過爲ANOVA添加-n 500命令而強制排列的數量沒有成功。

我對fsl（tbss）不夠自信，所以我不明白程序是做什麼的，爲什麼它不做排列。有人有什麼主意嗎 ？ 感謝您的幫助。

Answer 1

我不確定你是否需要design.grp。根據我的理解，-e design.grp選項僅適用於Within/Mixed組設計（如配對T檢驗或重複ANOVA）。請參閱這裏瞭解可交換性塊：https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/PALM/ExchangeabilityBlocks