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我想用nipype來分析由FSL創建的轉換矩陣。 FSL有一個名爲「avscale」的腳本,用於分析這些轉換矩陣(* .mat文件)。 我想知道nipype是否有換行腳本,並啓用其輸出到任何工作界面。avscale(FSL腳本)是否有任何nipype接口?
感謝
我想用nipype來分析由FSL創建的轉換矩陣。 FSL有一個名爲「avscale」的腳本,用於分析這些轉換矩陣(* .mat文件)。 我想知道nipype是否有換行腳本,並啓用其輸出到任何工作界面。avscale(FSL腳本)是否有任何nipype接口?
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基礎上docs和current source答案是否定的。另外,至少從去年2月起,nipy-devel郵件列表中還沒有提及avscale
。這有可能是Nipype已經包裝別的東西,做這個(也許用MATLAB包裝?)你可以嘗試opening an issue或詢問的mailing list。
只要你想使用Python(與nipype和所有的),也許nipype項目的理念是,你應該只使用numpy的/ SciPy的這個?只是猜測,我不知道用這些工具複製這個輸出的功能。也有可能沒有人開始添加它。
對於外行來說,avscale藉此仿射矩陣:
1.00614 -8.39414e-06 0 -0.757356
0 1.00511 -0.00317841 -0.412038
0 0.0019063 1.00735 -0.953364
0 0 0 1
併產生這種或類似的輸出:
Rotation & Translation Matrix:
1.000000 0.000000 0.000000 -0.757356
0.000000 0.999998 -0.001897 -0.412038
0.000000 0.001897 0.999998 -0.953364
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
Scales (x,y,z) = 1.006140 1.005112 1.007354
Skews (xy,xz,yz) = -0.000008 0.000000 -0.001259
Average scaling = 1.0062
Determinant = 1.01872
Left-Right orientation: preserved
Forward half transform =
1.003065 -0.000004 -0.000000 -0.378099
0.000000 1.002552 -0.001583 -0.206133
0.000000 0.000951 1.003669 -0.475711
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
Backward half transform =
0.996944 0.000004 0.000000 0.376944
0.000000 0.997452 0.001575 0.206357
0.000000 -0.000944 0.996343 0.473777
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000