快速訪問DICOM圖像中的像素值

我想比較DICOM圖像的數據集，以便我可以選擇最適合在opengl中進行體積渲染的數據集。我需要帶有r，g，b和alpha通道的DICOM圖像。快速訪問DICOM圖像中的像素值

所以，基本上，我想要一個應用程序，如在Ubuntu的irfanView我只需要點擊一個點，我得到相應的像素信息。

我不想要一些像itk或dcmtk這樣的C++庫。我不知道如何用imagemagick做同樣的事情。有誰知道這樣的應用程序？

一些進展：我用DCMTK（雖然我寧願用貴的東西），並使用此命令：

$ dcmdump .DCM 一個巨大的輸出來，它看起來像：

DICOM標準的文件-format

DICOM的元信息報頭

二手TransferSyntax：小端外顯（0002,0002）UI = MRImageStorage＃26，1個MediaStor ageSOPClassUID （0002,0010）UI = LittleEndianImplicit＃18，1 TransferSyntaxUID

DICOM的數據集二手TransferSyntax：小端隱（0008,0005）CS [ISO_IR 100]＃10，1 SpecificCharacterSet （0008 （0008,0018）UI [1.3.12.2.1107.5.2.4.7259.20010531113752000010358]＃48，CS [原始\仲裁\ MPR] ，1 SOPInstanceUID （0008,0020）DA [20010302]＃8，1 StudyDate

等等......直到...

（7fe0,0010）OW 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 ...＃131072，1 PixelData取出

這是最後一個在那個輸出中。這是我正在尋找的信息。但我如何提取完整的像素數據，而不只是它的一個小樣本？

來源

2012-06-13 Kishore

您是否在尋找一個支持此功能的現成應用程序，或者您是否想要一個可插入自己的「數據集選擇」應用程序的庫？ –

一個現成的應用程序，以便我可以快速查看rgba值在不同像素處的內容...就像在irfanview中，如果可能的話 – Kishore

我不知道有這種功能的任何自由DICOM圖像編輯器，所以我建議你在一個兩步走的方法做到這一點：

使用工具來轉儲你的DICOM圖像的常規圖像格式，例如dcm2pnm，在DCMTK binary distribution（至少Windows發行版）中可用作預編譯二進制文件。
使用任何工具進行圖像查看和編輯（例如IrfanView）來檢查轉儲的圖像。

來源

2012-06-13 10:02:56

是啊...我做了這個..謝謝 – Kishore

@Kishore只是爲了確認，你_did_嘗試用於轉儲映像的_dcm2pnm_應用程序？在上面編輯的文本中，您已應用_dcmdump_。據我所知_dcmdump_沒有足夠的功能來轉儲像JPG，PNG，BMP等常規圖像格式。你需要_dcm2pnm_。 –

嗨，好吧，我做了dcmdump .dcm + L打印出.dcm文件中的所有信息。但現在，如果它會引起你的興趣，我還有一個不同的問題。 DICOM文件基本上是JPEG文件。 JPEG文件是RGB值或YBR值的集合。 JPEGs顯然不提供有關像素透明度的任何信息。在這種情況下，我如何渲染這些3D圖像，並期望圖像具有半透明性，以便我可以看到外層包含的所有重要特徵？ – Kishore

快速訪問DICOM圖像中的像素值

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