2017-03-19 86 views
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我正在使用RcppEigen爲我的R包編寫一些C++組件,並且在此上下文中使用typedefs時遇到問題。下面的代碼不會編譯:用typedef使用Rcpp編譯錯誤

// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]] 
#include <RcppEigen.h> 

using namespace Rcpp; 

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1; 

// [[Rcpp::export]] 
MapAr1 myFun(const MapAr1& x){ 

    MapAr1 y = x; 
    y[0] = 0; 

    return y; 

} 

以下是錯誤:

==> Rcpp::compileAttributes() 

* Updated src/RcppExports.cpp 
* Updated R/RcppExports.R 

==> devtools::document(roclets=c('rd', 'collate', 'namespace')) 

Updating my_package documentation 
Loading my_package 
Re-compiling my_package 
'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore \ 
    --quiet CMD INSTALL '/my_path/my_package' \ 
    --library='/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53' --no-R --no-data \ 
    --no-help --no-demo --no-inst --no-docs --no-exec --no-multiarch \ 
    --no-test-load 

* installing *source* package ‘my_package’ ... 
g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/local/include -I"/my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I" /my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/RcppEigen/include" -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o 
** libs 
RcppExports.cpp:10:1: error: ‘MapAr1’ does not name a type 
MapAr1 myFun(const MapAr1& x); 
^ 
RcppExports.cpp: In function ‘SEXPREC* my_package_myFun(SEXP)’: 
RcppExports.cpp:15:42: error: ISO C++ forbids declaration of ‘type name’ with no type [-fpermissive] 
    Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP); 
             ^
RcppExports.cpp:15:50: error: template argument 1 is invalid 
    Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP); 
               ^
RcppExports.cpp:15:58: error: expected initializer before ‘x’ 
    Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP); 
                 ^
RcppExports.cpp:16:40: error: ‘x’ was not declared in this scope 
    rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x)); 
             ^
RcppExports.cpp:16:41: error: ‘myFun’ was not declared in this scope 
    rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x)); 
             ^
make: *** [RcppExports.o] Error 1 
ERROR: compilation failed for package ‘my_package’ 
* removing ‘/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53/my_package’ 
Error: Command failed (1) 
Execution halted 

Exited with status 1. 

相同的代碼編譯封裝外部。所以我猜測,有些東西沒有正確複製到RcppExports文件。在嘗試使用RcppEigen命名空間時,我也注意到了類似的問題:using namespace RcppEigen;未被複制。

任何想法如何解決這個問題,而無需手動修改RcppExports? 謝謝!

回答

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您因堅持typedef而讓您的生活過於複雜。一旦將其包含在文件和您的功能簽名中,它就成爲界面的一部分,因此也需要在您的RcppExports.cpp中。所以你需要提供'更高一級'。

但有一個規定:調用文件pkgname_types.h,它將被包括在內。我創建了一個簡單的包eigentest並在src/目錄中添加的文件eigentest_types.h

#include <RcppEigen.h> 

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1; 

然後將它與

#include "eigentest_types.h" 

代替typedef添加到您的代碼段。

這就是你所需要的 - 只需用你的包名稱替換eigentest即可。

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非常感謝!現在確實有效。很高興知道這個... – ixpl